為解決金門地區水資源問題，金門自大陸引水案已列入水利署研擬「金門地區整體供水改善綱要計畫」中，這項綱要計畫並已奉行政院102年4月15日核定。目前雙方正就水價進行洽談，若本月底前順利完成簽約，預估施工期約1年5個月，明年底完成水管工程、水質檢驗，最快105年上半年開始供水。
經濟部水利署長楊偉甫表示，由於金門縣位處離島，興建水庫不易，且雨量較台灣少，加上金門當地水庫屬於淺碟型、蓄水量少，夏天容易優養化，水質較差；水源主要仰賴湖庫、地下水、海淡水，自產水成本每度約50、60元，過去金門缺水時都由台灣運水，每度水成本高達200元以上，成本相當高。
自陸引水成本低 又可改善金門缺水
隨著兩岸政治環境改變，楊偉甫指出，水利署評估金門自大陸引水成本較低，且可改善目前金門缺水情況，這個想法也在兩岸兩會會談獲得共識。
去年6月21日兩岸兩會第九次高層會談達成「兩會有關解決金門用水問題的共同意見」。兩會認為，金門用水攸關民生問題，通過兩岸合作解決金門居民用水問題，有助於兩岸關係良性互動，兩會願積極全力促成。雙方同意依各自程序協調主管部門積極推動，共同落實相關事宜。
解決金門基本用水最佳選擇
大陸引水因具有地理位置、成本價格與質優量足等優勢，因此經評估仍為解決金門基本用水問題之最佳選擇。
去年8月29日在福州舉行第一次工作商談，初步擇定由晉江引水（上游水源為山美水庫，經金雞橋閘引水至龍湖，並由晉江丙洲以海管接到田埔水庫旁上岸，海管長度約16.879公里），並建立未來工作商談協調機制。投資發包工作，大陸方負責其陸域之管線、設施等工程，我方負責自晉江丙洲接到田埔水庫之海底管線佈設工程。
後續相關商談，並陸續確認包括引水規模（設計規模採3.4萬CMD設計，初期引水1.5萬CMD，逐年慢慢增加，最高可擴充至5.5萬CMD）、水質標準、水量計量方式等。
目前已進入引水契約簽訂階段
水廠廠長王登緯表示，兩岸相關商談工作，目前已進入引水契約之最後階段，又海底管線工程部分，水廠於今年3月上旬完成總顧問之簽約，目前已完成招標文件之準備。若後續引水契約順利簽訂，本案工程可望於105年完工通水。
這條備受矚目的供水路線，引水源頭除了晉江山美水庫的配套工程外，還包括晉江流域之上的東溪和西溪水源，這些水源將匯集到金雞攔河閘，以此為起點，經晉江供水引至晉江市境內的天然湖泊龍湖。在龍湖設取水泵站，經泵站加壓後送水至晉江市金井鎮的丙洲，並在丙洲村附近入海，埋管穿過圍頭，在經由跨海輸水管，到達金門田埔水庫，故本次供水路線由取水泵站、陸地輸水管和跨海輸水管等組成。其中，陸地輸水管線總長54.10公里，海上管線長16.67公里（跨海管道最大水深達24.3米）。
由於金門水資源自大陸引水計畫為兩岸交流首例，故此類案件產生風險影響相當重要的，未來應建立兩岸水資源往來常態觀察機制與風險監測指標，持續觀測缺水風險、供水水質風險，並應隨時檢討、研擬相關可行之緊急應變措施。
水利署：金門自大陸引水 沒有國安疑慮
水利署長楊偉甫強調，由於金門自有水源必須占7成，因此金門自大陸引水沒有國安疑慮，且水質無論是在引水端或接水端皆需經過檢驗。
惟海底管線可能受天然、人為、物理、政治等因素影響導致供水中斷，因此即使自晉江引水後，仍須維持金門湖庫水導入淨水廠功能，於供水中斷時可恢復湖庫供水；同時檢討辦理集水區污染源改善及湖庫空庫改善工程。
地下水方面，則可於引水期間，逐步降低地下水抽取量，讓水位回升，但維持21口井每日3小時抽水量約500噸／日，避免深井抽水設備閒置過久造成故障。此外，並保留1,500噸／日地下水抽取量供金門酒廠使用。海淡水方面，仍維持既有已核定開發計畫，作為供水中斷時重要之自有水源。
田浦水庫作為受水調節池 確保供水穩定
若面臨水源中斷情形，田埔水庫作為大陸引水至金門受水端調節池，其59萬立方公尺庫容，可因應金門地區約40天用水，配合維持運作之海淡水4,950噸／日可定點供水，以及作為飲用水、維持功能之地下水井，提高抽取量至10,000噸／日支援。另外在應變期內，湖庫水源逐日恢復抽取至21,239噸／日，且目前金門地區東西半島之管線均有連通，未來水源或水質發生狀況時，將可立即啟動備用機制，投入供應民生所需，不會危及金門維生系統，未來並定期（1～2年）進行備用系統之運轉，以確保供水之穩定。
另外，根據學者專家研究，金門自晉江引水之特殊性有五：其一，合作對象為福建省，必須適用兩岸人民關係條例等相關規定。其二，金馬地區屬於離島，相關特別法有「離島建設條例」及「試辦金門馬祖與大陸地區通航實施辦法」之適用。其三，跨區取供水行為涉及國際貿易活動，應注意「貿易法」、「貨品輸入管理辦法」、「台灣地區與大陸地區貿易許可辦法」、「大陸物品之輸入管理規定」、「關稅法」、「海關進口稅則」等相關規定之適用。
其四，由於目前可能的取供水雙方均屬具有行使公權力性質之政府機構，則取供水行為在各政府機構內部涉及公權力行使，就水的購買及設施興建方面，應併考慮政府採購法及相關子法之規定。其五，「水」本有其特殊法律規定，例如「水利法」及「輸入食品查驗辦法」等，亦必須納入考量。