縣府自「公文線上簽核系統」上線以來，因速度及系統問題常接獲各局處反映，行政處除函請各單位提出系統問題，並已著手協調改善。
　為再了解各單位目前對系統改善需求，行政處也擬行文各機關調查有無「公文線上簽核」系統問題，俟彙整各機關問題後，將與廠商研究解決之道，務求完善。
　另有關筆硯製作開檔與傳送緩慢問題上，經向全國各縣市政府請益，均比較傾向於筆硯製作系統自身技術問題，因筆硯屬主管機關國發會檔案管理局委外開發，縣府將適時向該局反映目前所遇問題。
　而有關開放本縣公務機關以外地點進行公文線上簽核乙節，經詢全國各縣市政府，目前均面臨國家法令，因為規定需以實體的憑證（如自然人憑證）進行公文線上簽核，而目前全世界的行動裝置（如平板、手機等）皆不支援實體憑證。經向金門大學請益，該校目前允許不使用實體憑證進行線上簽核，然若帳號被盜，則可能衍生重大資安事件；在金門地方法院方面，目前仍未導入公文線上簽核；樹德科技大學則未啟用實體憑證，如此雖可在學校以外進行公文線上簽核，但與金門大學一樣，容易衍生重大資安事件，且無法達唯一性及不可否認性；又以上三個單位亦均表示往後將參考縣府辦理公文線上簽核，而縣府與全國縣市政府的線上簽核系統，係依國發會檔案管理局規定，均通過該局的安全與功能認證的系統。
　因國家在線上簽核上已訂定諸多規定，是以資訊安全與方便性，究竟如何取捨，乃屬國家應考量與取決的重大政策，建請依循政府制度法規及考量目前技術成熟度等因素來發展本系統。
　此外，為提升縣府暨所屬各機關公文處理效能與流程管控，行政處除已按月定期將公文處理時限作資料統計，以及辦理逾30日之分析與建議函送各單位外，並請各機關文書人員每週應將逾期公文清單送交機關首長，另亦不定期針對承（會）辦逾期公文進行稽催，如已逾期達30日以上公文將進行個案分析，以明其責任。
　另關於公文之處理時限，除監察案件不得申請展期外，其確無法於處理時限內辦理完結者，應敘明具體事由，報請權責主管核准後辦理展期，為強化內部控制機制，行政處亦將不定期進行查考。