吳阿瑾試圖把禪學的觀念融入治療，他認為，讓病人放鬆，平靜，柔軟，改變就有了可能；引導病人去發現自己美好的潛能、美好的特質，就可能修正一直讓自己受苦的行為！（張建騰攝）

金門醫院精神科主任吳阿瑾因為從事心理醫療，研究慧能禪法與心理治療，轉而把禪學當成自己生命的終極目標。
吳阿瑾於一九八九年由臺北醫學院醫學系畢業，現為金門醫院精神科主任；他曾規畫成立金門醫院精神科的日間留院和急、慢性病房醫療復健服務。他唸過佛光大學宗教研究所，論文主題是慧能禪法與心理治療；他堅信人心的鍛煉與思想的自由，可以增加人類生活的福祉。
透過對金門精神醫療體系的建立，吳阿瑾希望讓病人的身體、心理、社會各層面的健康能維持於幸福狀態；讓病人被同理心對待，被關懷，被尊重；讓病人的權利能獲得最好的捍衛，可以在社會上存活很幸福又有尊嚴。
吳阿瑾表示，他高中畢業選擇醫保成為內科醫師，轉而成為精神科醫師，這一切都出於偶然，卻也因為這樣的歷程，讓他撞進了另一個足以生死相許的領域，那就是禪學。他說：「我提早經驗到了！」「我撈到了！」他把禪學、佛學當成了終極關懷的目標。他希望未來在禪學，在佛學有更大成就。對他而言，那是生命的自由，是對生命的解放！
吳阿瑾在接受精神專科訓練時，開始對禪學產生興趣。四十四歲那年，他曾放下醫療工作，到佛光大學唸宗教研究所，於民國九十九年完成論文《壇經慧能禪法對諮商與心理治療的應用》。他在研究中假設中國禪宗六祖慧能禪法對現代心理治療有其應用價值，建立一種以慧能禪法為中心的諮商心理治療模式是可行的。
論文中提到：六祖慧能主張人皆有般若智與清淨真如佛性，但因本心迷失而陷入煩惱。求解脫，求自在的關鍵在於轉迷為悟。方法是「無念、無相、無住」三無法門。慧能的人性觀、由迷轉悟的方法，還有頓悟成佛的目標，符合現代諮商心理治療的定義。
美國學者卡巴金曾開創正念減壓門診，利用正念禪修治療慢性疼痛及情緒困擾。卡巴金講的正念與慧能的無念是一致的。新一代認知行為治療學者也應用正念來進行心理治療，例如席格爾等人開創了正念認知治療；黑耶斯創立了行動治療；賴能菡開創了辯證行為治療。他們的實證研究，都證明了禪修的心理治療成效。
吳阿瑾表示，「正念減壓」等觀念來自中國佛教的禪學；外國學者把它們運用在心理治療，結果是「中禪西用」，又回到了台灣，反而華人未能率先從自己的文化中去汲取法寶。
吳阿瑾一直對《六祖壇經》很有興趣，這是唯一一部佛教中國化的本土經典，而六祖慧能則是中國禪的真正創立者。
吳阿瑾因為為學習心理治療，學來學去，最後卻撈到自己文化裡的東西，他覺得實在很有趣。慧能主張每個人有清淨佛性、善良本性，只是自己一直沒看到，拚往外找還是找不到。吳阿瑾試圖把禪學的觀念融入治療，他認為，讓病人放鬆，平靜，柔軟，改變就有了可能；引導病人去發現自己美好的潛能、美好的特質，就可能修正一直讓自己受苦的行為！
過去，精神病常被污名化，吳阿瑾認為精神病不應該是一種污名，就像身體的感冒要看醫師，心理的感冒也需要看醫師。又如，一般失眠的人會先看家醫科，但其實很多失眠者是因為身心不協調，有很多事沒有處理好所致，他們第一個需要看的其實是精神科！
精神病也常被與怪力亂神混在一起；不過，吳阿瑾卻不與宗教治療站在對立面。他表示，人不知道的遠比知道的多！如果想用知道的去解釋不知道的，那就太過張狂了！因此，對於求神問卜，他以前或許會覺得可笑，但現在則尊重他們的體系。畢竟，「巫醫同源」，大家都想解決問題。不過，現在的乩童也會要病人去看醫師；病人也會發現就醫、服藥的好處；吳阿瑾認為，這也是一種進步！
目前因為有精神科的存在，可以讓三分之一的病人明顯好轉，讓三分之一的病人維持不好不壞，但還是有三分之一的病人會因為找不到原因而持續惡化。除了努力把握住那三分之二外，吳阿瑾總會鼓勵病人：不自殺，保證就會有好的機會！要勇敢地活下來！
對吳阿瑾自己而言，把病人治好就是最大成就感，把金門的精神醫療體系架構好，一直是他的使命，雖然這個使命並不容易達成。他說，當體系建構完成，也就是他可以離開的時候了！他曾一直自省過「到底要什麼？到底要什麼？到底要什麼？」最後的答案就是：對禪的追求！