金門降雨量連年減少，地下水超抽日益嚴重，大、小金門16口監測井水位降低面臨海水入侵，導致嚴重鹽化問題，衝擊金酒公司產值。金門縣自來水廠呼籲目前仍在使用地下水的用戶應該停止抽用，多多使用質優安全的自來水，以確保地區發展用水需求無虞及地下水資源可以永續經營。
　金門因隨著城市快速發展，用水需求急遽增加，地下水超抽日益嚴重，據金門自來水廠監測井水位統計分析資料顯示，自95年以後降雨量逐年減少，大部分監測井之地下水位已明顯下降了2公尺至5公尺不等，且大部分監測井之地下水位比起去年同期之水位皆有降低現象，16口監測井中以開瑄國小、柏村國小、上岐國小、金鼎國小、金沙國小、農業試驗所及金酒寧山庫降幅為甚，目前地區的民生供水地下井已有莒光和尚義二口深水井因海水入侵鹽化而封井，現今其他水井亦陸續面臨鹽化問題。地下水源如在經年持續超抽，海水將嚴重入侵鹽化地下水體，影響金酒公司產值，金西地區之自來水供應也將出現問題。
　金門縣自來水廠指出，在地面水源不足之情況下，目前水廠在供應西半島及烈嶼地區之用水，平均仍抽用地下水量約12,000CMD，在大陸原水引入後，地下水將逐步減抽。由於大陸足量優質原水將於106年開始引進，初期引水量為1.5萬噸，送至洋山淨水場處理，屆時東半島之產水量及水質可再提升，多餘水量將由既設300mm的東西半島連通管線送至西半島，西半島地下水量將開始逐步減抽，隨著大陸引水水量逐漸提升後，足量且質優的自來水將由配水系統配送至西半島各角落，屆時水廠在西半島之地下水將完全停止抽用，可予地下水適當保育，以維續金酒之經濟命脈。
　自來水廠表示，金門東半島各地面湖庫原水水質不佳，為提升金沙與金湖地區供水品質，榮湖淨水場於101年1月份完成「增設後端高級處理流程」（包括活性碳、超過濾及逆滲透等高級單元)，每日可產3,000CMD高級水。接續於103年10月完成「太湖淨水場整建及功能提升工程」，辦理原傳統流程之改善及高級單元之增設(含生物硝化池、超過濾及奈米過濾等高級單元），每日可產8,000CMD高級水，產水皆能充分去除影響口感物質及消毒副產物等污染項目。由於東半島自來水水質已大幅提升，故水廠呼籲目前仍在使用地下水的用戶應該停止抽用，多取用自來水。
　自來水廠進一步指出，烈嶼地區亦有原水水質不佳之問題，鑒於「大小金門海底連通管線」已建造完成，且經測試無漏水之虞；為徹底改善該地區居民之飲水，以自101年2月份起，全面由大金門引優質地下水取代，水質已獲得改善，目前每日供水約1200CMD。本縣西半島地下水水質雖然乾淨優良，但水廠取用地下水時，仍需經過加藥與除鐵錳處理後，方能符合飲用水水質標準規定。若民眾擅自取用地下水作飲用或盥洗，恐因地下水未經消毒處理，造成民眾發生大腸桿菌群感染等疾病。為維護民眾飲用安全，建請民眾向自來水廠申請自來水接管，多多使用質優安全的自來水，減少使用地下水。