地區東半島及烈嶼鄉水質問題，在經過金門縣自來水廠進行設備提升，加強改善供水品質之後，目前上述地區的自來水水質業已大幅改善，水廠請民眾可安心飲用家中的自來水。
金門地區東半島及烈嶼地區各地面湖庫原水水質不佳，為提升供水品質，自來水廠表示，東半島的榮湖淨水場已增設了「後端高級處理設備」，包括活性碳、超過濾及逆滲透等高級單元；又太湖淨水場業經整建及功能提升，包括新增生物硝化池、超過濾及奈米過濾等高級單元，已經完工驗收，可針對優養化的水庫水質充分地處理，各項污染物也能充分去除；至於烈嶼地區之自來水，已幾乎全由大金門地下水供應，供水品質與大金門西半島同屬優質地下水。
自來水廠指出，縣長陳福海就任後，相當重視地區水資源的開發，並且積極要求自來水廠提升供水品質，應該以優質的水質來提供用戶，用戶自水龍頭取到之自來水要能夠飲用，且管線系統之供配水要與加水桶之供水水質相當。經水廠不斷的淨水改善，今年以來的產水已趨穩定，供水品質也皆大幅提升，各項污染物指標受檢均能符合飲用水質標準，尤其是「消毒副產物」之濃度，均能低於飲用水限值甚多，在「口感」方面也都大幅改善，今年夏季期間不再出現諸如紅蟲、異味或其他水黃等等之水質異常現象。
另外，依據今（一○四）年水質受檢數據顯示，「總有機碳」濃度小於2mg/L（飲用水水源限值為4 mg/L）、氨氮小於0.05mg/L（飲用水限值為0.1 mg/L）、消毒副產物─總三鹵甲烷小於0.06mg/L（飲用水限值為0.08 mg/L）、總溶解固體小於350mg/L（飲用水限值為500 mg/L）、總硬度小於100mg/L（飲用水限值為300 mg/L），今（一○四）年度之受檢合格率可望達99.9%。
自來水廠表示，由於目前金湖、金沙及烈嶼地區之供水水質已十分優良，且供水系統亦與供水桶之供水水質相當，希望民眾可以不用再辛苦的至供水桶取水，可多多取用自家龍頭自來水作為飲水。此外，水廠更呼籲，目前雖然地區各供水系統之水質已提升，但用戶對自家水塔也要定期清理，至少每年要清洗一次，才可保證用水安全。
另外自來水廠還指出，有很多用戶原本有地面水池，且採馬達間接抽水至屋頂的水塔再配水至屋內的各用水龍頭，此種供水方式才是正確的用水方式，但現在有很多用戶私自拆除地面水池，尖峰用水期間由於水壓較小，故自來水無法上到頂樓之水塔，常常向水廠反映水壓不足或誤以為水廠有停水，所以水廠也呼籲用戶必須保留地面水池，自然就不會有缺水或水壓不足之情形發生。