莫蘭蒂風災迄今已逾二個月，有關災後風倒木堆置及後續處理，金門縣政府前後召開多次研商會議，最終也確定，珍貴殘材的再利用除了將公開標售，相關碎木處置，也將由建設處統籌委外處理。
林務所在做殘材處理評估專案報告亦指出，由於殘材數量龐大，若不謹慎處理，恐引發火災、飛安、環保等議題，且後續相關殘材規劃處置更需要縝密的評估。因此，林務所在草擬專案報告時，起始即臚列了四大計畫目標：1、辦理標售作業，再創殘材價值。2、碎製減少體積，降低火災風險。3、挑選可用樹木，殘材活化利用。4、木屑利用評估，研擬後續用途。
為處理這批數量龐大之殘材，縣府先前曾邀請林業、工研院專家，以及民間菇類、有機肥相關業者至現地勘察，相關預擬施行作業包括殘材標售、樹木挑選及碎製處理，唯經挑選之剩餘殘材、枝葉，不論是作為後續生質能源利用，或菇類、有機肥培育，皆需進行破碎處理，其中菇類培育還有數種選擇性，所以在碎製前需加以分類，方可供後續使用。
至於有關碎製後各方案說明，經工研院專家推薦，相關木屑可將其作為木顆粒（由木屑壓製而成），木顆粒是歐美國家新興生質能源產業，台灣也有相關綠能廠商可製作。未來只需將現有鍋爐設備稍加改造，即可用木顆粒取代柴油，作為相關鍋爐之燃料，不但可以減少殘材數量，亦符合本縣低碳永續生態島的理念。
但此項技術當前最大的困難是，若木顆粒要運送台灣，其運送成本將大幅降低廠商意願，故需以本地工廠鍋爐為主要對象，以金門地區現有工業發展規模而言，僅有金門酒廠有其設置規模，是否能達應有的成本效益，仍需從長計議。
而在菇類養殖方面，目前金門地區僅有一家菇類培育業者，經現地踏勘後，該業者表示，以金門現有的菇類培育技術，太空包內最多需要木麻黃量為3成，其餘樹種則占7成，但樟樹等具殺菌精油之樹種則不宜放入，故在木屑碎製前需加以分類，以免混入影響菌類生長。
此外，縣府指出，莫蘭蒂重創金門，金門林木更是首當其衝，隨著相關救災工作告一段落，縣府也研提了一項林業5年復育計畫，除了配合地區觀光發展需求，辦理道路與造林區栽植更新，也將逐步改善地區行道樹環境與營造具特色道路之道路景緻，漸進完成地區行道樹與造林區林木復育工作。