經濟部工業局為協助金門、澎湖、馬祖產業創新發展以因應全球自由化浪潮，成立「產業升級轉型服務團」，並在中央及地方政府的支持下於去（105）年底始執行「離島產業升級輔導計畫」，以協助離島產業創新升級。
這項計畫由食品所主導並納入穀研所、工研院、鞋技中心、紡織中心、石資中心及印研中心等法人之能量，組成專家顧問團，透過提供離島地區企業諮詢診斷及產業技術輔導、產品開發、代工廠媒合、商品設計行銷及食品從業人員衛生安全教育訓練等全方位服務，協助離島產業全面提升。
為順利推動計畫之執行，經濟部工業局率領離島計畫團隊分別赴金門、馬祖、澎湖與當地地方政府、工商協會、業者及離島大專院校(金門大學、澎湖科技大學)交流座談，了解需求及產業發展方向。
在多方的溝通協調與籌畫下，已於106年5月17日及5月25日分別在金門大學及澎湖科大成立「產業升級輔導辦公室」並辦理揭牌啟動典禮；輔導辦公室成立後將與兩所大學、工商協會組成「產業發展諮詢平台」，透過辦公室收集離島產業之共通問題，邀請法人、學術以及產業界等專家，提供諮詢或技術輔導，並進一步提供當地業者即時諮詢服務與協助，改善離島資訊取得不易及專業人才不足的問題。
此外，食品所亦依各島之需求辦理企業座談與案例分享活動，積極與地方業者、社區協會進行意見交流。活動包括金門特產創新及策略加值分享會、澎湖食品包裝及機械設備展示與諮詢、馬祖酒廠教育訓練及企業座談會、馬祖莒光地區企業及社協座談會等。
其內容分別針對地方特色食品之產品開發、食品添加物應用實務、借鏡國外地方特產市場拓展經驗、離島產業園區之規劃進展、優質酒類認證說明、酒粕美妝品開發、以及水產品包裝及應用案例分享等。
　工業局表示，透過溝通打造更適切的解決方案，整合資源提供輔導與協助，以落實中央政府促進離島產業發展的目標。