國立金門大學針對「反教育商品化聯盟」所公布「學店經營大學排行」中，金門大學的生師比、住宿率及學雜費調漲問題，提出說明，強調金大今年並未申請調漲學雜費，全校生師比（含進修學制）為20.39，並非該聯盟所公布之24.94。
金門大學說明的內容，包括：一，國立金門大學的日間部生師比僅17.73，全校生師比（含進修學制）為20.39，並非該聯盟所公布之24.94。二、 金大每年日間部新生約850人，學校可提供新穎的學生宿舍床位1186床，因此新生皆有床位。全校日間部學生3416人，住宿比例34.72%，高於一般水準。三、 金大今年並未申請調漲學雜費，且自98學年起即未調漲過學雜費，目前的學雜費低於大多數的國立大學。四、金大獲教育部及金門縣政府的經費支持，並有眾多東南亞僑領及地方鄉紳捐資興學，學校將豐厚的公共資源投注在教學研究，使得校務發展日臻卓越。目前學雜費收入僅占全校總經費不到1／3，大多數的教學研究經費都是其他各項公共資源的挹注，因此學生繳交相對低價的國立大學學雜費即可獲得優質的國立大學教學品質。
金大指出，金門大學除有教育部的支持外，還有金門縣政府及來自馬來西亞、新加坡、印尼、汶萊等海外僑領和金門鄉親的大力贊助，讓金大近年來校務發展蓬勃，且學生表現也深受業界肯定，吸引許多台灣明星高中畢業生前來就讀。為獎勵優秀學生到金門大學就讀，將頒給以指考成績入學且前三志願錄取金大的學子獎學金最高達24萬元。另外，針對弱勢學生也特別提供安心就學獎學金，讓有心向學的學子可以在金門大學實現理想。