國內進行全國畜牧場雞蛋芬普尼殘留檢驗，共四十七牧場雞蛋檢出芬普尼，因國內雞蛋檢出芬普尼是首例，部分縣市已完成內部行政程序，將發送裁處書。金門動植物防疫所表示，雖然地區未檢出任何違法使用廠商，但業者們仍需注意用藥安全，以免誤觸法令遭關場。
此次的事件按違法使用藥品提供裁罰依據。因飼主曾將未核准動物用藥品（即含芬普尼成分之藥品）直接或間接使用於禽隻，造成雞蛋殘留芬普尼，已涉違反動物用藥品管理法第32條之3規定，使用動物用偽藥或來歷不明之動物用藥品，應依同法第40條之1第1項第1款裁處飼主新臺幣6萬元以上30萬元以下罰鍰。
另依動物用藥品管理法第46條規定，裁罰係直轄市或縣（市）主管機關之權責，故畜禽場發生動物用藥品違規案件，應由所在地直轄市、縣（市）政府依法展開調查，並製作訪談紀錄，再依據查處結果裁罰，同時辦理後續安全用藥輔導。
目前相關單位均依法執行芬普尼檢出場之移動管制、查明藥物殘留原因、藥物來源及後續裁罰作業。同時，芬普尼已列為養禽場例行檢驗項目之一，檢驗工作不會中斷，動植物防疫所特別呼籲農民切勿抱有僥倖心態。至於農委會也鄭重宣佈，未來一旦有蛋雞場違規使用芬普尼的情形，初犯者直接重罰30萬元，再犯者最高可裁罰250萬元，另，農委會刻正修正《畜牧法》，未來若發生重大食安事件，則直接撤照撤證，勒令違法蛋雞場關門。