澎湖、金門、馬祖、蘭嶼、綠島及琉球等地區之營業人，依離島建設條例第10條第1項規定，凡於當地銷售並交付使用之貨物或於當地提供之勞務，免徵營業稅；惟離島免徵營業稅實施注意事項第7點亦規定，離島地區經核定使用統一發票之營業人，依規定可適用免徵營業稅者，仍須依法開立統一發票及申報銷售額，另依稅捐稽徵機關管理營利事業會計帳簿憑證辦法第21條規定，營利事業應於對外營業事項發生時，取得他人原始憑證。
　根據國稅局表示，常有離島地區之營業人，誤以為既然適用免徵營業稅規定，於進貨時可無須取得進項憑證，銷售貨物時亦可免開立統一發票給消費者及申報銷售額，導致被檢舉或被查獲有違章情事，營業人雖無逃漏營業稅問題，但仍有進貨應取得憑證而未取得，銷貨應給與他人憑證而未給與之情事，依稅捐稽徵法第44條規定，應分別按查明認定之總額處以5%行為罰。
　國稅局特別提醒，離島地區之營業人，於進貨、銷貨時切記依法取得及給與憑證，以免受罰。