教育部國教署成立「推動學校午餐專案辦公室」，從制度面著手盤點問題與改善學校午餐品質，並由行政院食品安全辦公室賡續106年聯合稽查專案，指導規劃辦理「107年學校午餐聯合稽查專案」，邀集行政院農業委員會、衛生福利部及各直轄市、縣(市)政府共同繼續為學校午餐食安把關，執行期間自3月1日開跑預計至6月30日結束。
　106年學校午餐聯合稽查專案，採先輔導後稽查方式分三階段執行。執行成效卓越，教育部國教署亦針對縣市政府所提出之學校廚房設施設備改善需求申請進行審查補助。
　107年學校午餐聯合稽查專案計畫執行期程為107年3月1日至6月30日，教育部已於2月份召開行前說明會議，主要進行106年聯合稽查專案執行結果與檢討，將去年執行經驗做為107年執行時應注意事項的精進改善措施，計畫稽查及輔導執行重點，包含「學校午餐驗收作業、四章一Q生鮮食材介紹及驗收應注意事項、學校及團膳業作業場所衛生安全查核及午餐成品與加工品或半成品食材衛生安全管理與抽驗」等，並依據學校衛生法及相關子法規定，落實對於供膳學校、廠商採中央聯合稽查、地方全面監控及學校自主管理三級機制，為全國百萬學童午餐營養、衛生把關，達到學校午餐「食」在安全的目的。
　校園食安管理工作需要長期、持續且全面顧及，由中央到地方，教育、衛生及農政各單位彼此通盤合作才能夠完成，107年學校午餐聯合稽查專案，教育部、衛福部及農委會將在行政院食安辦的指導下，持續努力完成地方與中央聯合稽查工作，達到行政院食安五環政策「源頭管控、加強市場查驗及落實全民監督」之精神，及以積極強化學校午餐管理品質之最終目標。