為確保縣民生活環境品質，金門縣環保局於今年5月份持續針對縣內溪流、水庫水質進行採樣檢測，監測地點共有山外溪上游、新市里中興橋、山外溪中游、小太湖、前埔溪上游、前埔溪下游、斗門溪上游、斗門溪下游、光前溪上游、光前溪下游、田浦水庫、太湖、榮湖水庫、金沙水庫、擎天水庫等15處，並公布檢測結果，其水質檢驗值可至該局網站-便民服務-檔案下載。
環保局說明，其中11處溪流水質參考「河川污染指數（RPI）」計算所得之指數積分值，判定河川水質污染程度，計6處未（稍）受污染，2處輕度污染，3處中度污染分別為新市里中興橋、山外溪中游、小太湖，檢測結果水質優於今年第一季；4處水庫依「卡爾森指數，CTSI」所得之指標值，判定4處水庫水質呈優養狀態。
環保局表示，107年第一季因雨量較少，導致水庫水質不佳，但第二季進入豐水期，河川污染指數較今年第一季明顯改善。今年的重點除針對金門縣事業輔導、稽查管制外，將持續推動畜牧糞尿資源化，並呼籲106年12月27日前已取得畜牧場登記證者，飼養豬隻100頭以上未滿200頭之畜牧業，請儘早提送廢（污）水管理計畫，以符合法規規定（108年6月30日前完成）。