為鼓勵地區業者廢棄物回收再利用，本縣事業廢棄物收費標準自107年9月1日起將調整收費數額，針對廢木材混合物、廢陶瓷及廢石膏混合物、廢玻璃混合物、廢發泡塑膠（保麗龍）等廢棄物之代處理費用由每百公斤462元調降至250元，其餘廢棄物調降為每百公斤400元。
環保局指出，本縣因應清除處理成本提高曾於民國105年6月27日修訂金門縣廢棄物代清除處理收費標準，惟現行收費標準未針對再利用之廢棄物種類予以不同收費數額，本次為強化資源回收、循環經濟之理念，另列修訂調降可再利用之廢棄物種類收費金額，以鼓勵事業回收再利用，減輕環境負荷。
環保局說，本縣106年9月推動強制分類政策，部分不肖業者為節省廢棄物分類之人力、成本及規避清除處理費用，發生多起非法棄置遭移送地檢署法辦之情事，本次修訂收費標準期望藉由不同收費數額，減少業者成本負擔，鼓勵業者加強廢棄物分類後再進掩埋場處理，除了可節省荷包亦可達到節能減碳目的。
此外，環保局已推動營建廢棄物加強管制作為，除列管工程例行性巡查外，針對未列管工程、古厝裝修、裝潢裝修等小型工程加強稽巡查，確認廢棄物產出情形及是否妥善清除處理，如確定查有不法情事將依法處分；環保局並購置多台監視器錄影取締棄置廢棄物行為，再次籲請地區業者應依廢棄物清理法規定清除處理營建廢棄物，如民眾發現不法情事，請電洽該局公害陳情專線082-336823或0800-056580處理，共同營造整潔的優質生活環境。