疾病管制署自1月15日起將中國武漢新型冠狀病毒感染引起的肺炎列為第五類法定傳染病「嚴重特殊傳染性肺炎」，以強化該類疾病之監測與防治，降低國人感染風險。截至本年1月20日，中國武漢個案累計198例，3例死亡；且泰國、日本及南韓相繼出現境外移入確診個案，疾病管制署自1月16日起提升武漢市旅遊疫情建議至第二級警示。
金門縣衛生局表示，針對本疾病，本縣已完成相關防疫整備作為，包含衛生福利部金門醫院於1月9、10日及14、15日共計辦4場次醫療照護工作人員相關教育訓練，以提升人員對疾病之通報、照護等認知；並於1月15日辦理該疫情桌上演練，強化橫向聯繫及相關收治動線之熟練度。
衛生局指出，在1月16日進行醫院實地整備之稽查，稽查內容包含有動線規劃、該院之應變計畫整備、緊急調床及消毒作業及防疫物資貯備等多項，查核結果均符合中央規範。另衛生局也函請地區開業之醫療院所，加強落實問診機制，確實詢問並記錄旅遊史、職業別、接觸史及是否群聚等資訊，及病人分流看診相關感染管制措施及通報；並針對港埠及機場等發現之發燒個案，均加強疫情調查追蹤，直到個案症狀解除為止。此外，疾病管制署金門辦事處在小三通發燒篩檢站，針對攔檢的旅客，均會特別詢問武漢旅遊史，並加強衛教宣導。
衛生局表示，由於目前也是流感、禽流感及肺炎等呼吸道疾病好發季節，衛生局提醒民眾提高警覺，近期如計畫前往中國大陸武漢及鄰近區域，從事旅遊、探親、洽商等活動，以及回國時，務必做好個人防護措施。如在當地期間應該落實肥皂勤洗手、咳嗽戴口罩等個人防護措施。避免出入販售活體動物之市場或當地醫療院所等高風險公共場所、避免接觸活體動物及動物屍體及食用生肉及生蛋。
衛生局提醒，返國入境時，如出現發燒或類流感症狀，主動告知航空公司人員及機場港口檢疫人員。入境14日內如有異常狀況，可撥打防疫專線1922，並戴上口罩儘快就醫，就醫時告知醫師旅遊史、接觸史，以利醫師診斷及通報。建議生病應盡量在家休息，不出門，減少或避免與他人接觸。咳嗽或打噴嚏時，使用紙巾或衣袖遮住口鼻。若有呼吸道症狀，則應持續配戴口罩。