勞動部職安署經訂定「因應嚴重特殊傳染性肺炎（武漢肺炎）職場安全衛生防護措施指引」，協助事業單位落實職業安全衛生相關法令規定，並強化對職場生物病原體暴露危害之預防能力，有效防止疫情於職場擴散。
職安署表示，現行職業安全衛生法規已明定，雇主應採行各項必要之安全衛生措施，使勞工免於發生職業災害。近來因武漢肺炎疫情暴發，為促使事業單位加強職場防疫措施，該署特別摘錄現行相關法令規範，訂定職場安全衛生防護措施指引，讓國內業者對於職場防疫相關措施能有所依循，並提醒勞工朋友強化自我防護及相關勞動權益保障事項，期能透過勞雇雙方共同合作與努力，確實防堵武漢肺炎進入職場。重點如下：
一、雇主部分：（一）建立體溫量測及篩檢措施、加強勞工職場感染預防訓練、保持工作場所之通風、清潔與定期消毒。（二）置備適當及足夠之口罩，不得禁止勞工戴用；第一線工作人員如有感染之虞時，雇主應提供個人專用口罩並使其確實戴用。（三）以勞工健康安全為最優先考量，如非必要，應避免指派勞工前往中國大陸疫區。（四）對近期曾至疫區出差或旅遊返回職場之勞工，應採取必要之健康追蹤及管理措施。
二、勞工部分：（一）做好個人自主管理，使用肥皂勤洗手、避免前往疫區旅遊。若出現發燒、咳嗽等身體不適，請速就醫，告知醫師旅遊史、職業史及接觸史，並主動告知雇主。（二）如為交通站場、運輸工具、商場、百貨公司等第一線服務人員，宜配戴口罩。（三）如對安全衛生防護規定及權益保障有相關疑慮，可透過手機或市話直接撥打1955免付費專線尋求協助。
職安署強調，雇主未依職業安全衛生法令暨本指引辦理者，可依法處新臺幣3萬元以上、30萬元以下罰鍰，呼籲事業單位雇主，除配合衛福部疾病管制署之防疫措施外，並應依本指引採取相關預防措施，同時視疫情嚴重等級、事業規模、活動或服務流程，適時修正及調整，以確保勞工安全健康。