原先安置在小三通的體溫偵測儀，因小三通停航目前處在閒置狀態，縣府將行文中央借至尚義機場，強化機場防疫。（許峻魁攝）

為因應新冠肺炎疫情，加上台灣已出現首宗死亡案例，金門縣政府積極橫向串連複式防疫網，特別邀集交通部民航局金門航空站、衛生福利部疾病管制署、航空警察局金門分駐所、移民署、立榮航空、華信航空等單位，共同討論小三通暫時停航後，金門唯一的對外人流出口，如何有更完善的防疫措施，並決議增設紅外線影像體溫偵測儀，加強篩檢台金往返班機之旅客，同時針對篩檢入境發燒旅客將比照小三通就醫採檢模式處理外，也會積極掌控居家檢疫人員，確保金門防疫無漏洞。
會中，初步決議如下：
一、金門航空站比照國境等級防疫，增設紅外線影像體溫偵測儀，小三通目前暫時停航，縣防疫指揮中心將行文向中央防疫指揮中心，商借原放置在水頭碼頭通關處的紅外線影像體溫偵測儀，並支援檢疫人員。未來，金門航空站入境旅客都需監測體溫，將金門航空站之防疫等級拉升到國際航空站水準。借用期間，縣衛生局儘速購置2台紅外線影像體溫偵測儀，並派人員進駐航站，請航警配合管制陪檢，如有必要，請縣警局人力支援。金門機場若有發現旅客發燒，比照小三通旅客發燒模式，直接由縣消防局派車送往部立金門醫院篩檢，以落實掌控防疫。
二、積極掌控居家檢疫人員，目前國人透過兩岸直航回到臺灣後，第一線疾病管制署還需登打居家檢疫地址資料，等資料透過民政系統與警政系統的轉交，地方民政局至少會晚3│4日才能拿到需居家檢疫人員資料，恐成防疫漏洞。之前縣政府派員在水頭碼頭協助，當日即可獲得小三通入境在金居家檢疫旅客資料，立即進行管制，當時是全國最嚴謹的防疫作法。為有效縮減需居家檢疫入境旅客通報時間差，縣指揮中心將行文提報中央指揮中心，建請移民署提供入境資料介接至航警查核身分證系統，即時釐清是否為需檢疫人員，避免防疫漏洞。另外，若查到有旅客仍在居家檢疫期間來金，直接開罰並送警光會館強制執行。
會議中，衛生局特別說明，大三通入境後回金門居家檢疫的方式。大三通入境時，若鄉親填寫「居家檢疫通知書」居家檢疫地址為「金門縣」，應立即銜接金門班機返金住家進行居家檢疫。唯若返台班機太晚無法立即轉乘返回金門，疾病管制署同意，在台留宿一日，隔天在「無症狀」及「全程配戴口罩」之狀態下，搭機返金完成居家檢疫。面對嚴峻疫情，縣府以料敵從嚴的概念，推動複式防疫網，將疫情決戰島外的執行，過程可能造成來金旅客或返金鄉親的不便，但這是守住金門的必要手段。