為組織本縣優秀選手參加109年全民運動會，爭取優秀比賽成績，金門體育會訂定參加109年全民運動會選手初選報名要點，各參賽單位應於6月1日前將選手資料送體育會初審。
依據金門體育會訂定參加109年全民運動會選手初選報名要點規定，本次全運會大會比賽項目：
（一）第一類：健力、拔河、輕艇水球、合球、水上救生、蹼泳、飛盤、滑輪溜冰、滾球、運動舞蹈、原野射箭、柔術、沙灘手球。（二）第二類：傳統體育（民俗體育、太極拳、元極舞、龍獅運動、摔角、國術）、創意球類運動（躲避球、慢速壘球、木球、槌球、巧固球）、劍道、沙灘角力、龍舟及健美。
報名時間，各參賽單位應於109年6月1日前將選手資料送金門體育會初審。該會審查後於109年6月8日前轉送金門縣立體育場，於109年6月15日前辦理選拔委員會審查。
報名資格：
（一）戶籍規定：於其代表參加單位之行政區域內設籍連續滿三年以上者，其設籍期間計算以全民運動會註冊始日（即中華民國106年7月3日以前設籍者）為準。（二）年齡規定：依109年全民運動會各種類技術手冊規定辦理。（三）報名規定：依各種類選拔（遴選）辦法內「參賽資格」規定辦理。（四）凡被全國各有關協會及107年全民運動會判處停止比賽權尚未恢復者不得報名參加選拔（遴選）（含領隊、教練、管理、選手）。（五）身體健康情形及性別，由各組隊參加選拔（遴選）單位負責。
報名地點在金門縣金城鎮民族路261號2F，金門體育會。報名程序請自行上109年全民運動會籌備會上查詢（網址：sport.kinmen.gov.tw）。報名表格請上金門體育會FB下載。
而初選評比績分參考，包括：
（一）縣運會有辦理競賽之運動種類：1、107年全民運動會競賽種類競賽項目獲前6名者，成績依高低序計之（績分依序為7、5、4、3、3、3）。2、108年至109年參加本屆全民運競賽種類之全國各單項協（總）會舉辦之正式錦標賽社會組獲前4名者，成績依高低序計之（績分依序為5、3、2、2）。3、107年參加本縣縣運會（有列入全民運競賽種類者），獲前三名者（選手資格不符時依序由後遞補一名）（績分依序為4、2、1）。
（二）縣運會無辦理競賽之運動種類：1、107年全民運動會該競賽種類競賽項目獲前6名者，成績依高低序計之（績分依序為7、5、4、3、3、3）。2、108年至109年參加本屆全民運競賽種類之全國各單項協（總）會舉辦之正式錦標賽社會組獲前4名者，成績依高低序計之（績分依序為5、3、2、2）。 3、經主辦單位核準，而由本縣立案體育團體其所屬單項委員會辦理選拔前3名選手（績分依序為4、2、1）。
報名時應檢附近兩年（107-108）比賽成績證明，並以單位（委員會）報名，金門體育會不接受個人報名。報名參考要件：長期於本縣扎根推廣單項及往年參賽得名之單項為優先。