高雄市立大同醫院為顧及離島、山區、偏鄉民眾至大同醫院就醫路途遙遠奔波之辛，特設立友善就醫窗口，若民眾持金門醫院或金門縣各鄉鎮衛生所開立之轉診單或離島轉診交通補助單，可至該院一樓聯合服務中心「離島偏鄉友善就醫服務窗口」，將為民眾妥善安排就醫看診等服務。