有關金門地區醫療廢棄物處理費相較臺灣本島高一事，立委陳玉珍在立法院經濟委員會審查離島建設基金預算時，當面詢問國家發展委員會主委龔明鑫，針對「不具經濟規模之特定廢棄物的處理運費」，可否由離島建設基金來補助。龔主委答詢時表示，會與衛福部共同研商處理，以解決離島建設需求。
根據國發會針對110年度離島基金預算所提供的書面報告指出，離島基金截至目前為止，基金餘額為27億5310萬6千元，而110年度預估基金收入為137萬1千元，基金支出為4億901萬5千元，預計110基金餘額為18億5962萬4千元。報告中也提到，金門縣第五期離島綜合建設實施方案的發展定位與目標係結合自然資源調查保育、原有林相營造、維護傳統建築風貌、觀光產業服務品質提升、燃油機車汰換、消防救災器材汰換、紅火蟻及非洲豬瘟防疫等23項計畫，離島基金共補助7.09億元。
陳玉珍指出，整體離島建設基金補助各離島縣的案件數及金額呈現下滑趨勢。從數據上來說，第四期離島綜建方案離島各縣市共補助142案，35.6億元，到了第五期離島綜建方案，離島各縣市共補助109案，30億元。國發會一再說，離島建設基金不用撥補到300億元，用多少補多少，但實際上來看，顯然基金水平逐年降低的結果，就是在審查相關補助案件會趨於嚴格，讓原本設置離島建設基金是要來補離島公共建設預算支出之不足的美意大打折扣。
陳玉珍表示，「離島的醫療廢棄物」因處理量有限，廠商承攬意願低且清運成本相較臺灣本島為高，致增加醫療院所營運負擔。為此，金門縣議會有建請縣政府向離島建設基金申請經費補助醫療廢棄物處理費。從實際數據來看，金門醫院每公斤需多支出約142元之處理成本，該院每月需額外負擔約42萬6,000元的費用，一年就要多511萬2000元的營運成本。
陳玉珍說，依照「離島永續發展規劃暨離島建設基金計畫補助原則」第四十六條規定，「不具經濟規模之特定廢棄物的回收工作，補助回收資源與廢棄物後送之處理運費」是可以申請離島建設基金來補助的，以維護離島地區資源公平分配原則。因此，她殷切希望，未來若金門縣政府提出該項補助計畫時，國發會應給予全力支持。主委龔明鑫回應表示，會與衛福部來共同研商處理。
陳玉珍並提到，金門醫療資源較台灣本島少，未來若能打造醫療特區，不但可吸引國內外優秀的醫療人才，吸引醫療機構進駐，資源自然就會變多，既可改善醫療環境，也可以替金門招商創造經濟效益，一舉兩得，這部分也請國發會一併研議評估，以徹底改善金門醫療資源不足的長期問題。