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中央流行疫情指揮中心表示，10月11日起，全面開放Moderna COVID-19雙價疫苗，提供18歲以上民眾追加劑接種；10月13日起，調整校園防疫措施，被匡列者於「自主防疫期間」符合一定條件下，可到校上課、上班。
金門地區指揮中心說明，Moderna COVID-19雙價疫苗自9月24日陸續開放第一階段、第二階段符合資格者，作為接種追加劑，截至10月6日，金門縣累計施打人數355人，呼籲符合接種資格之鄉親，能儘速前往合約醫療院所預約接種疫苗，以提高保護力，鄉親預約接種時，須與最後一劑基礎劑／基礎追加劑或前一劑追加劑應間隔至少12週（84天）。
10月13日起，調整校園防疫措施部分，學校教職員工及學生，如其家人或同寢室室友確診，「打滿3劑疫苗」，可選擇「0+7」，即免居家隔離，直接實施7天的自主防疫；「未打滿3劑疫苗」，則必須執行「3+4」，3天居家隔離與4天自主防疫。在自主防疫期間，如有症狀，不可到校（班）上課、上班，如無症狀，且有兩日內快篩陰性結果，可到校（班）上課、上班，幼兒園、補習班及課後照顧中心比照辦理。
地區指揮中心提醒，雖然中央自10月13日起，放寬邊境管制措施，入境人員免居家檢疫，改採7天自主防疫，但確診者，仍維持「7+7」的居家照護與自主健康管理，請鄉親務必注意相關規定，避免受罰。地區指揮中心昨（7）日公布金門地區新增103例COVID-19確診者（統計時間6日0-24時）、確診者累計16,620例（含軍人及觀光客等外來確診個案），約占本縣常住人口25.02%；確診者解除隔離15,971例。為防範流感與COVID-19疫情雙重衝擊，地區指揮中心再次呼籲鄉親儘速完整接種疫苗，在任何場域，都應該維持良好衛生習慣，保持社交距離，落實手部衛生與佩戴口罩等個人防護措施；出現類流感症狀儘速戴口罩就醫，並在家休息，減少病毒傳播機會；減少參與集會、餐聚與大型活動，宴席不得逐桌敬酒敬茶，用餐盡量採用外帶方式；避免出入人多擁擠的場所，或高感染傳播風險場域；主動積極配合各項防疫措施，共同嚴守社區防線。同時，衛生局也會持續確保藥物準備充足、監測中重症治療情況、以及監控社區與機構感染及傳播狀況。