配合「2026金門馬拉松活動」，1月24日及1月25日縣內多條公車路線將調整改道或將部分班次停駛，影響路線包含藍1、紅1、2、3、5、5A、6、6A、7、7A、7B、8、9、10、11、12、15、15A、15B、35及36路。
車船處說明，1月24日當日，藍1路金城往返山外之07:30及08:30班次，將改行駛伯玉路，不經部分原行經市區路段；3路金城往返山外之07:00及08:00班次，亦配合交通管制改道，行駛伯玉路、桃園路、榜林東洲路口、東洲及后湖等路段後續行原路線至山外車站。另6路07:35班次、6A路07:05及08:25班次均停駛；7路、7A路於上午尖峰時段班次，以及7B路09:00班次亦停駛；8路07:45、08:35及09:10班次同樣暫停行駛，相關影響時段請搭車民眾特別留意。
1月25日賽事主要活動日，公車路線調整範圍與影響層面更廣。藍1路金城及山外07:30班次，將不繞行金城市區，改由東門、縣議會一帶行駛；紅1路清晨及上午多個班次，則配合交通管制不經榜林圓環，改行桃園路及盤果路，以避開馬拉松賽道路段；2路金城及山外部分班次，同樣不繞行榜林圓環，改由盤果路通行，維持基本運輸服務。
往返沙美的5路及5A路，於活動當日維持原訂發車時刻，但行駛動線調整為經榜林東洲路口、孚佑廟、金酒寧山、金門酒廠、盤果路、頂堡、東堡溝及瓊林地區後，再銜接原路線行駛至沙美車站。6路金城往金門城07:35班次，亦不繞行金城市區，改由東門進出。7路、7A及7B往返水頭方向之部分清晨與上午班次，則統一改行東門及北堤路，以兼顧賽事進行與民眾交通需求。
此外，9路、10路、11路及12路公車，於上午至中午時段多個班次停駛；往返烈嶼的15路、15A及15B路，部分班次停駛，其餘班次則改經金門大橋通行，行駛金城新莊、香格里拉、金門大學及東坑、湖下等路段後續行原路線。35路清晨班次停駛，上午班次改行林湖路；36路07:00班次亦停駛。
車船處表示，金門馬拉松為年度大型體育活動，賽事期間需配合道路封閉、人流與交通動線調整，公車路線異動屬必要措施，對民眾造成不便敬請見諒。車船處並呼籲搭乘公車前先查詢最新班車資訊，或彈性調整出門時間與替代路線；活動期間亦請用路人配合現場交通指揮，共同維護賽事安全與交通順暢。相關詳細班表與調整內容，已公告於車船處官方平台，歡迎民眾多加查閱，以利行程安排。