「金門縣牧馬場」於民國49年7月1日成立，68年5月1日為發展肉牛產業改制為「金門縣畜牧場」，復於74年9月1日為統合地區畜產機構，合併金門縣農業試驗所畜牧課及后壟種豬繁殖場，改制為「金門縣畜產試驗所」，擔任地區畜牧輔導與產業推廣業務，除了積極配合縣府政策發展產業外，也透過爭取離島建設基金中央補助款的方式補助地區產業發展。
中央補助款最早可以追溯至民國68年由農發會補助60餘萬元，由台灣引進小乳牛40頭進行乳牛試養，隔年投資180餘萬元，興建乳牛舍與搾乳室，採購全自動搾乳機及冷藏儲乳等設備，至此奠定地區乳牛事業基礎，供應當時地區軍民飲用，72年農委會補助400萬元興建各項設備等工程，逐步完成地區鮮乳供應鏈，此後的20年畜試所擔起全金門縣軍民與國小及幼兒園的鮮乳供應，現有優良乳牛一百八十頭，著重於乳牛產乳量之控制及研究，提供優質乳品及強化產能，採用最現代化科技設備高溫瞬間滅菌法，過程中營養損失最少，又可保持生乳原味，口感自然，風味獨特；並設有乳品加工廠及乳品檢驗室，以產製各類乳冰品，計有瓶裝鮮乳、紙盒裝鮮乳、冰棒、冰淇淋、優格、優酪乳等產品，並以「青草地」品牌行銷市場迄今，成為地區鄉親的一項共同回憶。
金門縣政府有鑑於台灣牛肉消費多仰賴國外進口，且需求連年增加，本土牛肉有很大的拓展空間；又金門酒廠每日產出大量酒糟，是牛隻最佳飼料之一，可取代大豆粕和玉米來肥育牛隻，以降低牛肉生產成本，而且以酒糟餵飼市場接受度極高，已成為金門地區的一項特色產業。自民國95年起離島建設基金挹注推動「金門地區酒糟養牛計畫」，建置金門縣內酒糟肉牛特色畜牧產業，增加國內牛肉佔有率及建立金門特有牛肉品牌，提升金門農民之收益，用更宏觀的視野角度提升產業的發展，並將觸角伸至國際知名飯店，以其高知名度與口碑，轉而成為金門酒糟牛肉的行銷助力，續將推出金門酒糟牛肉麵節等推廣活動，提升曝光度與能見度，旅客來金門可按圖索驥，達到整體產業升級效果，促進地區整體利益與觀光發展。
因國民經濟能力提升，牛肉需求大漲，近年來受美國牛肉開放進口爭議影響，民眾需求安全牛肉的呼聲提升，金門縣畜產試驗所輔導農民建立以農業副產品肥育肉牛之飼養模式，降低養牛成本；畜試所全力推廣金門酒糟牛肉通路市場，導入金門特色美食觀光，讓在地金門牛肉業者，共創金門酒糟牛肉新品牌之金門魅力新亮點。並持續辦理各項飼養管理、疾病防治及畜產品加工等教育訓練班，以提昇農民專業技能並能精進地區畜產加工能力及品項。
金門畜試所以地區畜牧輔導與產業推廣為重點核心業務，為了達到推動產業發展向上提升的目標，在產、官、學各面向皆下足了功夫。如積極向中央爭取支持，將相關補助運用於促進地區產業發展；持續薦派同仁出外學習新知，與時俱進，將更新更佳之畜產相關專業知能帶回金門並廣為分享，提升地區產業專業能力；不定期舉辦畜牧發展研習、研討，邀請各界專家蒞金講授及經驗分享，為地區業者提供便利學習新知之機會，更為產業發展注入一股活水。
金門畜試所走過一甲子的歲月實屬不易，歷經多次組織改造與業務調整，重新找到自己的定位與方向，日益成長茁壯，成為帶領地區畜牧產業發展的火車頭，仍積極充實軟硬體設備，期盼能使產業與觀光、休閒相結合，配合縣府推展親子觀光政策積極轉型，搭配布拉安格斯園區啟用、金門青年餐飲輔導等整合行銷力量之開啟，嘗試導入觀光體驗遊程，並同步加強行銷推廣，目標是成為兩岸三地首屈一指的觀光牧場，增加金門東半島的旅遊亮點，未來的畜試所將持續致力於發展畜牧與產業輔導，並切合時代走向融入觀光旅遊轉型，交織出下一個精彩一甲子。