隨著台灣民主的深化，《促進轉型正義條例》不僅在2017年底通過施行，而且在其立法前後，也經常成為朝野政治攻防的主題。隨著2022年及2024年的地方與中央選舉，轉型正義的議題看來又會再度浮上新聞版面。但是，轉型正義首先應該是個國家工程，別說朝野之間需要有所共識，政府與民間也要充分溝通，因此，先別說它所強調的價值及運作的實況為何，轉型正義的課題目前在台灣仍是充滿了爭議。當然，有爭議存在並不是件壞事，不只因為在自由民主的社會裡，自然也就會有不同的立場，而且也就在爭議之間，可以促成不同的立場之間進行溝通。因此，不單單在這多元自由的民主社會裡，金門應該更要表現它的立場。而且，因為戰地政務的經驗，金門在轉型正義的議題上，還扮演了一個相當重要的角色，對於此一國家工程的課題，金門還有更積極的地位。
民主轉型在制度上充實了民意的上達，遂使得其間也出現了「台灣化」的現象。因此，台灣從過去被認為是省級的地方單位，變成了具有國家成份的認同。於是，過去包含了35省2個地方的「秋海棠」中華民國，別說接受了台澎金馬的現況，它的國家地位也受到以台灣認同挑戰。中華民國與台灣之間的選擇，即成為當下台灣政治的主旋律。此間，金門扮演了一個關鍵的角色：首先，過去的台灣對金門來說，不只是行政上與金門所在之福建省同等級的另一個省級單位，在地理上也就是另一個島。這種曾經相同的地位，如今卻是包含了金門在內的上位國家，遂使得台灣所指的內容為何，對金門人來說相當容易混淆；其次，中華民國政府在戰前即已統治金門，而在戰後才進到台灣。因此，當台灣逐漸具有國格之際，金門就成為捍衛中華民國的堡壘了。最後，這一堡壘不僅在冷戰時期如此，在後冷戰的兩岸政治裡，也正如此。這除了是因為小三通的地位促成兩岸溝通，也是由於捍衛中華民國，即可對外緩和兩岸的衝突，對內也真實而有效地實踐「中華民國台灣」的主張，促成不同政治立場的和解。
於是，此一緊扣著中華民國命運的角色，就成為金門論述轉型正義的基點，它不僅由於上述的原因而具有飽滿的正當性，還因為它在冷戰時期的歷史，而更豐富轉型正義的論述。當下之所以要進行轉型正義，目的是為了讓那些受到非法的國家暴力侵犯的受害者，得到正義。因此，受挑戰的並不是中華民國的國格或法秩序，而是那些利用公權力的非法行為。冷戰期間，金門在最前線捍衛中華民國，因此不僅經受的是比戒嚴更嚴峻的戰地政務，還在兩岸對峙的情境底下而有更多忽視法律的便宜行事。因此，不合法律地侵犯人民生命與財產權的情事，恐怕不在少數。固然基於戰地政務的規定，金防部得以有超越當時法律規範的處置，但不免仍踰越合理公權力的行為。另外，金門縣府實則已經就戰地政務時期之自衛隊與土地徵用議題，採取對應的措施。然而這些措施尚未能拉高到轉型正義的層級，多僅涉及行政上的補償與歸還，而未觸及法律及政治之正義觀的論述。由此可見，在金門論述轉型正義，不只是發掘在地經受的政治暴力、弭平傷痕，同時還能更體貼地了解中華民國的處境。如此一來，論述金門的轉型正義不只是建構了金門的主體性，也為轉型正義提供了更豐富的內涵，並在與台灣社會對話之際，打造出一個更具正義性的中華民國台灣。