在疫情防控常態化形勢下，應廣大台胞需要，為進一步促進閩台兩地人員交流交往，便利在閩臺胞台企正常的生產生活，大陸福建省應對新冠肺炎疫情工作領導小組宣布自5月10日起有條件解禁小三通。對此，縣長楊鎮浯樂見陸方釋出有條件解禁小三通的善意，金門縣政府一直有做好準備，無論是人員、班次或檢疫管制等作為，當疫情可控、防疫無虞的狀況下，包含防疫旅館、地區防疫量能充足，他並呼籲中央應明確回應，由於小三通是在總統蔡英文過去擔任陸委會主委期間開辦，並向總統蔡英文喊話，若時間點以及條件成熟下，有條件的讓小三通復航，也顯示蔡總統兩岸交流的善意回應。
中國大陸福建省應對新冠肺炎疫情工作領導小組（指揮部）綜合協調組4月29日針對台胞赴閩公告系列便捷措施，自5月10日零時起，福建省將展開台灣民眾來閩入境檢疫便利通道措施試點工作，對急需來閩工作或進行重要商務、重要交流活動，並透過福建對台海空客運直航口岸來閩（目前為廈門機場口岸）的台人，實施「2天集中醫學觀察，19天閉環管理」的措施，管理期間允許台人在加強防護、做好健康管理前提下，實施「住宿地-單位-住宿地」兩點一線邊觀察、邊工作。
其中攸關「小三通」的入境措施是在金門、馬祖連續居住滿28天以上的金門、馬祖籍居民，通過「小三通」客運直航口岸入境者，視同為大陸低風險地區入（返）閩人員進行管理，無需隔離。但入境時仍需提供「台胞個人健康承諾書」（應附入境前28天無金門、馬祖以外地區旅居史有效證明材料）、金馬地區醫療機構出具的入境前7天內核酸檢測陰性有效證明、台灣居民來往大陸通行證或台灣居民居住證等文件。
面對大陸單方面解禁措施，金門輿論熱議對於循小三通人員往返是否隔離一事仍有諸多疑慮，連最基本連續居住滿28天以上的金門籍居民證明由哪個權責單位核發？質疑在變種新冠病毒造成全球疫情再發燒，加上國內華航機師、諾富特防疫旅館事件讓台灣本土疫情爆發，面對疫苗注射覆蓋率不足、採檢費用過高、防疫旅館和醫療體系是否能承載染疫或隔離的人員，能確保金門「零確診」防疫不產生破口，民眾是抱持相當保守看待。
受新冠肺炎疫情影響，基於金門當地防疫考量、國內防疫規劃及尊重地方民意所為的決定，去年2月10日宣布暫停金廈小三通航線，至今已經停擺一年多，重創金門地區的觀光民生經濟。小三通復航對金門的各項產業影響非常的大，縣府也為重啟小三通做好相關的準備，小三通復航並非放棄防疫，而是要在金門防疫能量許可下進行，也向中央提出報告說明，期望中央能給予明確的態度回應。欣見陸方已釋出小三通有條件放寬境管措施的善意，這也可以作為之後隨著疫情和緩，兩岸進一步恢復交流、往來的先期準備。
對於陸委會一貫的政策是在疫情可控前提下，恢復小三通兩岸人員往來交流的整體規劃，將在兼顧防疫及逐步推動兩岸交流，配合中央流行疫情指揮中心對疫情的科學判斷、國際間疫情的發展，還有國內防疫量能及兩岸互動情勢等相關因素來檢討，因為涉及整體疫情變化、金馬地方民意、防疫能量及兩岸互動等考量，陸委會目前會同中央流行疫情指揮中心、交通部等相關機關共同研擬、評估中，會在確保國內防疫無虞後，推動雙邊正常有序的往來與交流。
金門CIQS各單位身居國門第一線，審視地區防疫能量、收治與採檢等層面的衛生局、警消與岸巡等單位，並擇定防疫旅館或集中隔離場所，完善各項防疫環節與配套措施，以利未來在重啟小三通時，確保鄉親健康安全無虞。邁入後疫情時期，陸方已逐步鬆綁境管措施，尤其小三通方案已請中央部會協助，實際執行方向與內容，仍待中央各單位經過政策評估與決定，縣府也將全力配合，在政策定調前，預先做好準備與因應，期盼小三通早日重啟，恢復昔日榮景。