衛福部長陳時中過去曾指出，當國內第2劑疫苗覆蓋率達6成，可開始討論小三通復航，達8成就考慮開放邊境；截至11月9日為止，金門地區第一劑疫苗覆蓋率已達80.88% ，第二劑疫苗覆蓋率也有58.24%，已經快達到陳部長當時開的條件，但是小三通何時復航？卻沒有聽到樓梯響。
金門縣政府10月23日開設大型接種站，提供55歲以上縣民接種第2劑莫德納疫苗。縣長楊鎮浯表示，金門常住居民第1劑疫苗覆蓋率已達8成；隨著民眾施打第2劑莫德納疫苗，疫苗覆蓋率初估可達5成；施打率的提高，不只很多管制措施有鬆綁的機會，甚至為進一步洽談恢復小三通或其他開放措施創造有利條件。
受疫情影響，自2020年2月10日起，小三通中斷至今，陸委會主委邱太三11月9日在立法院答詢指出，小三通重啟須由中央流行疫情指揮中心評估，需與金門縣政府洽詢防疫量能，包含防疫旅館、金門醫院整體的醫療設施，再做綜合研判。陳時中部長則指出，小三通開放需先滿足國內第2劑疫苗覆蓋率達6成的目標，這是討論的基礎值，沒達標不會輕易開放邊境，至於其他考量因素並非指揮中心所能置喙。
小三通中斷至今已21個月有餘，今年是小三通二十週年，如果加上2003年發生SARS事件，小三通為此停航二個月，加起來停航已經接近二年了，因此今年慶祝小三通二十週年慶，有點名不符實，扣掉停航的二年，真正通航只有18年而已。
小三通究竟何時可通？從陸委會和中央疫情指揮中心的回答，似乎都在推責任給對方，陸委會推說要由疫情指揮中心去評估，疫情指揮中心則說若有「其他考量因素並非指揮中心所能置喙」，看在金馬兩地民眾眼裡，這種互相推諉的態度，真讓人痛心疾首，對中央官員不能苦民所苦感到失望。
隨著各國逐漸挺過2019冠狀病毒疾病（COVID-19）Delta變異株帶來的嚴峻挑戰，疫苗覆蓋率也漸漸提高，美國、日本、新加坡、印尼、泰國、馬來西亞等國正計劃逐步放寬邊境管制，對「完整接種疫苗」的旅客鬆綁限制，希望在疫情與經濟活動間取得平衡。
臺灣大學公共衛生學系陳秀熙教授表示：「疫苗護照勢必會成為未來的國際趨勢。」但也需考量到歐美國家與台灣對於「防疫」概念本質上的不同，新冠疫情自從2020年初爆發，時至今日病毒的侵擾已超過1年半，但西方國家每日仍有上千，甚至上萬人染疫，因此他們採取的是「與病毒共存」的方式讓社會持續運轉，「清零」對目前的歐美國家十分困難，「降低重症以及死亡率」則是當前的首要任務，適時地開放邊境與人民的自由，藉此換取經濟動能繼續運作。
隨著各國逐漸挺過2019冠狀病毒疾病（COVID-19）Delta變異株帶來的嚴峻挑戰，疫苗覆蓋率也漸漸提高，美國、日本、新加坡、印尼、泰國、馬來西亞等國正計劃逐步放寬邊境管制，對「完整接種疫苗」的旅客鬆綁限制，希望在疫情與經濟活動間取得平衡。
小三通二十年下來已是金門經濟的重大命脈，停航近兩年來對地區經濟的打擊是不容小覷，雖然政府實施多項振興措施，但是仍然杯水車薪，只能救急卻不能救命，長遠看來還是要儘速恢復小三通，才能挽救地區經濟於水火，縣府應挾民意為後盾，努力為小三通復航創造有利條件，希望兩岸能儘早協商，期望在年底或明年初可以讓鄉親看到一絲曙光。