「水頭港大型旅客服務中心新建工程」岸間廊道日前舉行上樑典禮，由縣長楊鎮浯親自主持，在與會各界的見證下定位鋼樑，象徵整體工程進度又再跨出一大步。目前工程已達成整體1樓樓板完成重要目標，整體工程預計113年7月可完工，未來啟用後將能為小三通旅客提供更優質服務，提升每年旅運量。
總工程經費為28億840萬元整的金門水頭港大型旅客服務中心新建工程於109年11月26日決標，由永青營造工程股份有限公司承攬施作，109年12月31日完成簽約，110年2月23日正式開工，工期為1,050日曆天，預計於113年1月工程竣工。
這項地區重大工程可以說和金門大橋一樣，一波三折，水頭港大型旅客服務中心新建工程，基本設計105年10月31日通過；細部設計106年8月24日通過，原本預計於107年2月開工，108年9月竣工、12月驗收完成、109年2月移交啟用。
但是工程先是招標不順，歷經10次流標，終於在2018年11月2日（第11次開標），才由「啟赫營造股份有限公司」得標承攬，工期900日曆天，預訂在110年下半年完工使用。不料，承包商在隔年9月25日發生財務問題停工，港務處經循「終止或解除契約及暫停執行標準作業流程」及契約規定啟動「書面通知」、「現場督導」及「召開會議」等程序後，並辦理「逐離接管會勘」。
109年3月港務處終止與啟赫營造公司之契約，後續委由設計監造團隊辦理評值結算及修正招標文件，於109年2月重新啟案，分別於109年3月及6月辦理兩次招標文件公開閱覽，並分別於高雄、台中、台北及金門辦理四場招標說明會，於109年7月正式辦理公開招標，歷經三次公開招標，順利於109年11月26日決標予永青營造工程股份有限公司。
經由設計監造建築師事務所修正招標文件後，旅客服務中心維持原4層樓鋼構建築的規模，總樓地板面積為3萬5946.54平方公尺，尖峰時段每小時雙向可容納2800人次，年旅客量可容納350萬人次，並且維持原本各樓層使用空間機能包括：一樓配置為入境區；二樓配置為辦公區；三樓配置為出境區；四樓配置為船舶調度中心屬管制區域。並設定全案分段進度及里程碑，加強管控工程施工期程，全案施工工期為1050日曆天內竣工，總工程預算也由21億多提高到28億840萬元整。
歷經10年14標的「金門水頭港大型旅客服務中心新建工程」，自2021年2月23日開工以來，至今工程進度已達23.99％，進度超前1.07％。上樑結束後象徵著旅客服務中心進入嶄新的里程碑，目前「水頭港區S2~S3浮動碼頭增設工程」、「南碼頭區公共設施工程」等水、陸兩部分的設施已經陸續完成，水頭港大型旅客服務中心是其中最重要環節，必須確保工程能如期完工，但就算如此和原先預期的完工日期已晚了三年。
大型旅客服務中心未來完工之後，位置在目前水頭港新港區南岸，整體建築規劃為4層樓鋼構，總樓地板面積約36,000平方公尺，一樓規劃為入境層，三樓為出境層，實現完善的分流規劃，內部空間寬敞明亮，將大幅提升航廈服務水準，並帶動地區產業發展。
目前疫情狀況逐步趨緩，未來配合中央疫情控制政策努力下，於完工後積極與對岸廈門五通三期新碼頭展開復航作業與對接工作，希望透過水頭港區整體發展，打造友善與永續的旅運環境，促進金門地區的觀光發展。
水頭港大型旅客服務中心是小國門，也是小三通的門面，相對於陸方小三通廿年來，先由和平碼頭，再移往東渡碼頭，最後到五通碼頭，每個碼頭都是建設得美輪美奐，每次的移動都會帶來該地區的繁榮發展，人家是有計畫性移動，相對於我方，金門確實需要有新的地標、新的門面，祈願水頭港大型旅客服務中心能早日完工啟用，讓金門在小三通復航後有嶄新的願景可期。