坊間各種說法，無不清楚說明宮廟及宗祠在金門地方聚落上的重要性。如「無宮無祠不成村」或「無宮無祖厝未成村里」，抑有「無祖厝（宗祠）無宮（廟宇）鄉里勿會興」，抑或「有村必有廟，無廟不成村」、「無宮無祖厝、勿會（不會）成鄉里」……等。
若從政治、文化、社會、經濟、歷史、法律、人類學觀察聚落、宮廟及宗祠三者關係。聚落不僅是人類生活的空間，更存在文化與歷史的印記；後者宮廟與宗祠不僅是民間信仰的一環，更是居民精神生活與人類學、社會學延伸。若再進一步延伸金門的宮廟與宗祠的關係，將可發現二者的共存、互動與普遍性，早已植基在金門這片土地且根深蒂固。
首先，在宮廟與宗祠的共存與互動上，又可包含互補關係與動員網絡。前者，在金門264座宮廟之中，宮廟滿足了居民對神明的信仰需求，193座宗祠則強調血緣宗族的連結。兩者在聚落中共同扮演著精神支柱的角色，形成互補的關係。至於後者，宗族關係是宮廟動員的重要基礎，宗祠成為連結族人、共同參與廟會活動的樞紐。這種緊密的互動網絡，強化了聚落的凝聚力。
至於宮廟與宗祠的普遍性又蘊含對神明信仰的深層影響，以及強化對聚落認同感。前者神明信仰，金門居民對宮廟信仰的熱情，顯示神明信仰在當地文化中根深蒂固，對居民的生活產生深遠的影響。後者聚落認同，宮廟與宗祠是聚落的共同信仰中心，透過參與廟會作醮與宗祠吃頭活動，居民建立起強烈的聚落認同感。然而隨著事物改變及星辰移動，亦有值得深入的問題如二者互動機制、變遷與功能轉型。
首先，二者互動機制又可分成祭祀活動的整合與資源的共享、競爭。前者在祭祀上，不同姓氏的宗族在同一座宮廟中進行祭祀活動時，如何協調與整合？後者資源上，宮廟與宗祠在資源有限的情況下，如何分配與利用資源？是否存在資源競爭的情況？
次者，宮廟與宗祠變遷又可分成傳統信仰與現代化的衝突與外來宗教的影響。前者在衝突上，在現代化浪潮下，金門居民的宗教信仰是否發生了改變？傳統的宮廟信仰如何適應新的社會環境？後者外來影響，其他宗教的傳入是否對金門的宮廟信仰產生衝擊？
最後，宮廟或宗祠的功能轉型又可分成傳統宗族觀念的弱化以及宗祠的保存與活化。前者，隨著社會結構的變遷，宗族觀念是否逐漸弱化？宗祠的功能是否發生了轉變？後者關於保存與活化上，如何在現代化過程中，保存和活化傳統的宗祠建築，使其發揮新的社會功能？各項都是後續耐人尋味、值得思考議題。
未來在宮廟與宗祠調查研究或發展方向，應可擴大研究範圍比較不同地區宮廟與宗祠文化的差異性如金門與廈、漳、泉等；次則，多角化分析則可從政治、歷史、社會、文化、經濟等多角度分析二者在聚落中的作用；再則，方法上抑或結合量化與質化研究，更全面地了解研究對象；最後，應關注年輕一代對二者的態度，探討傳統信仰的傳承問題。
揆諸前述，鑲嵌在金門聚落中的宮廟與宗祠，被視為地方重要文化資產，提供了這片土地非常寶貴的資料，同時亦為相關研究提供了新的視角。未來應可從多角度對二者進行深入的研究，拓展國際視野，讓更多人了解鑲嵌在金門聚落的宮、祠文化。