當時政府鑑於大陸反共戰爭的失敗，部分原因係未動員民眾支援軍勤任務。所以開始組織民眾，務使「人人納入組織」，將男子十八歲至四十五歲納入編組，稱為任務隊；十八歲至三十五歲未婚女子編成婦女隊，十五歲以下至十二歲之少年為兒童隊，建立民防體系的雛型。

邱仕財先生回憶說：「民國三十九年，村指導員開始訓練任務隊。凡轄區內十八歲至四十五歲之男子分為擔架隊、輸送隊，協助軍隊運送彈藥、搶救傷患等任務。十六、十七歲及四十六至五十歲為護路隊，主要工作是道路的維護。此外，還有婦女隊、兒童隊及文教隊。任務隊的編組大約每班十人，三個班組成一分隊，一分隊大約三十人，分隊長選派優秀隊員出任；分隊以上為中隊，一中隊大約百餘人，中隊長由村指導員兼任。」

民國三十九年，組織日益嚴密，將民眾分區組織救護、運輸、擔架、消防、護路、婦女、兒童、文教等八種戰時各種任務隊。一般民眾則簡稱為任務隊。民防隊一般業務由軍管區民政處軍事科負責管理，惟任務隊之指揮、訓練、運用仍由駐軍負責。行政公署成立後，一切管理指揮方式仍沿續過去，惟行政公署時常利用機會檢閱戰時任務隊。組訓工作平時由行政公署負責，金防部加以督導；戰時民防隊之運用，仍由金防部統一指揮。

任務隊主要負責運輸、擔架及各項軍勤任務，為應付戰爭隨時都有可能發生，軍管區民政會議曾決議：各種戰時任務隊在大潮時集中控制四分之一，各區擔架應保持數目。戰時榮譽官兵之協助看護及茶飯之燒煮應由婦女隊負責辦理，俘匪茶飯之燒送由婦女隊負責辦理。

至於平時的動員方面，溫仕忠先生回憶說：「包括開路、搭橋、護路、挖壕溝、督建防空洞、造林、興修水利設施等。一般說來，金門的主要幹道都是部隊興築的，但部分支道則是利用民防隊開築的，例如珠山到官裡的公路，就是在我擔任珠山指導員時指揮任務隊完成的；開築公路遇有溝渠，就需搭橋；護路工作，金門早期的道路都沒有舖設柏油及水泥路面，每遇下大雨，路面就會被沖走流失，不利車輛行駛，所以編有護路隊，由十六至十七歲及四十六至五十歲之男子組成，負責道路及橋樑維護；挖掘壕溝，防備敵軍戰車進犯；督建防空壕，九三砲戰之前主要是防空，戰後偏重防砲；造林，每位隊員每年種五棵，必須負責存活，指導員要督導檢查、每村里及鄉鎮之間還有比賽。」

洪福田先生回憶說：「國共在金廈海峽對峙，軍方為因應戰時需要，將全島的壯丁全部納入編組，稱為任務隊，負責運輸、擔架及各項軍勤任務。記得三十八年底開始，我曾帶著村裡的壯丁幫部隊挖戰壕，這條戰壕從青岐烈女廟後方通到上庫村，溝寬約三、四公尺，深達十公尺，每天配合部隊要求的進度挖掘，工期持續了好幾個月。」