清水祖師俗名陳應，是宋人，因為家裡很窮，從小就出家當和尚，可是住持心腸不好，常常虐待他，挨餓挨打是家常便飯，於是祖師便逃到安溪清水巖，在巖下發現一個小洞，這個山洞非常神奇，不耕不作就能長出稻穀，吃多少長多少，不會不足也不會剩下，祖師爺就在洞中修行，圓寂以後被奉為神。

一般民間所供奉的清水祖師神像，多為黑面孔，有人又稱他為「黑面祖師公」。

這「黑面祖師公」之由來，在民間有則傳說：

─「傳說，清水祖師在清水巖修行的時候，附近有鬼怪擾民，清水祖師為消滅鬼怪，相約以法力比試，輸者任憑對方處置。鬼怪把清水祖師關在洞穴裡面，然後用火將他薰了七天之久，但很奇怪的，祖師並沒有被薰死，只是面孔被薰成黑色。輪到清水祖師出手，鬼怪用布裹住身體懸在崖上，清水祖師站在遠處，奮力一指布條，結果布條斷裂，鬼怪墜落深崖而死，村民從此過著安居樂業的日子。

據調查，金門供奉清水祖師的廟在金寧鄉、金湖鎮及烈嶼鄉分別有一座。正月初六是清水祖師爺的壽誕，烈嶼鄉青岐的清水祖殿每年皆舉行盛大的慶典活動。

據耆老稱，彭岩人有位林氏來烈嶼，早年曾挑了一尊清水祖師神像前來青岐村供人抽籤卜卦，並寄宿該村，然靈異之事卻不斷顯相，鄰近民眾連連三個晚上在其住處發現紅色火光，之後乩童起乩謂清水祖師要來該村(青岐)顯靈，庇祐境眾，善信們立即為祖師公雕刻金身供奉廟中，並在旁側供祀林伯仔的牌位，後來因為牌位遺失了，才又雕塑了一尊身著長衫馬褂的佛像予以祀拜。

東坑的「清雲祖師廟」主奉神為清雲祖師，乃因明末倭寇為患，烈嶼西方村的觀音山古剎(佛祖宮)及福上山保生大帝廟被毀損，東坑村的信眾即將落難失守的清雲祖師神像迎回村內供奉迄今。

湖井頭的「李府將軍廟」主奉神為李府將軍、真異大帝(祖師公)、清水祖師、清雲祖師、清彭祖師。

據本鄉耆老謂，黑面的清水祖師、紅面的清雲祖師、和全面的清彭祖師係兄弟，皆來自福建安溪彭岩。其中的清水祖師為什麼黑臉造型，耆老說了下面這段故事：

─「清水祖師，自幼父母雙亡，同嫂一起生活。有一天，嫂嫂要他到山上撿柴，當他把柴火撿回來之後，貪玩的他竟將雙腳伸入灶中當柴來燒，此事不巧被嫂嫂看到，嫂嫂怒不可止的破口叱責，小小年紀的他，這一嚇非同小可，整個人也就趕快往灶裡鑽，因此也就得道昇天，所以我們現今看到的清水祖師是黑臉。」

另有關清水祖師的傳奇，筆者臚列於下：

─宋神宗元豐六年，福建清溪地方鬧旱災，他被請去祈雨。沒有多久，老天馬上降下了甘霖，雨水就很充足，鄉人感念其恩惠，就請他長住在蓬萊山，特地為他建立精舍以予供養。他看見門前泉水清冽，於是就將精舍命名為「清水岩」，並在此修行十九年。由於他獨力募化，廣結善緣，當地人對他十分敬仰，時常找他祈福消災。徽宗建中靖國九年五月十三日，他一早就叮囑後事，然後端坐而逝，時六十五歲。

─據說，他生前遊歷過清溪南邊的閬山，稱此為佛家聖地，幾十年後會在此現身。果然，到了高宗紹興四年，雷火燒山，徹夜不息。鄉人趕到人跡罕至的石門，見白菊一叢、薑三把，香爐裊裊生煙，上人或隱或現端坐在那裡。於是，當地人立即為他建祠，名為「清水別岩」。

─清水祖師，宋仁宗時福建泉州永春縣人，幼年出家，師事禪宗，學成後施醫濟藥救人無數，永春、安溪大旱，他又祈雨獲應，相傳祂乃抗元文天祥之部下，其後世助朱元璋打天下，死後升天，鄉人為祂造清水巖，玉皇大帝敕封為清水祖師。(劉還月著之「台灣歲時小百科，台原出版社，民七十九年)