瓊林位於金門島的中心點，原名坪林，明熹宗天啟年間，御賜瓊林里名，沿用迄今。瓊林村有四間寺廟，包含保護廟、孚濟廟、忠義廟、萬祠宮，其中以保護廟為最大，即為本村之主廟，自建廟以來，威靈顯赫，護國祐民，香火鼎盛，名聞遐邇。

早期保生大帝於大陸漳州角美鎮白礁升天後，神威遠播金門，每逢誕辰，金門香客往白礁朝聖者，絡繹不絕，相與結伴於途。昔有本村鄉老發願，虔叩聖駕蒞鄉興宮，蒙恩准聖杯三信，即夤夜恭迎以歸，並糾眾建廟奉祀，故廟內中殿柱石對聯云：「像塑真人位瓊林之寶殿，神尊大帝傳白礁之香煙。」大門前柱聯亦云：「悟道丹成傳白礁；回春法妙濟瓊林。」均明確道出本廟淵源自大陸白礁，薪火相傳。

瓊林保護廟相傳建於明朝(約西元1545年，距今約460年)，毀於兵燹，重建於清朝道光戊申年(道光二十八年，西元1848年)，凡二進，主祀保生大帝，配祀聖侯恩主、張府厲王，旁祀水府尊王與註生娘娘，並先後再供奉厲王二王、厲王四王、蘇府王爺、廣澤尊王、池府王爺、朱府王爺、金府王爺、下壇爺、三太子等諸神，迄今一百五十九年。

保護廟歷經清朝宣統二年(民前一年)重修，民國三年(西元1914年)奠安，民國三十七年(西元1948年)修葺，民國六十六年(西元1977年)再度重修，民國六十八年(西元1979年)再度奠安；本村保護廟甫於民國九十一年(西元2002年)又行重修，今年(西元2005年)，欣逢吉年，謹擇於十二月十一、十二日(農曆十一月十一、十二日)即將舉行奠安慶典，歡迎各界長官貴賓、各位鄉親蒞臨指導為禱！

本廟保生大帝聖誕為三月十五日，但不一定做醮，每年常以農曆三月十五日與八月十五日(大王爺聖誕)兩日輪流建醮。再者每年農曆正月初九日，則設清醮，以祀拜天公。另外每年正月十五日元宵節至正月十七日三日，為乞龜廟會，熱鬧非凡；早年曾有南管奏唱，盛況一時；近年社區與金門國家公園則舉辦猜燈謎活動，亦吸引人潮；正月十七日最後一日，按例推長老求籤問於帝君，來年是否五穀豐登，有求必應，靈驗不爽，令鄉民與信徒折服不已！

因保生大帝未升天前，乃以醫術聞世，羽化後即為神醫，屢次顯跡，拯救君后與天下蒼生，令人崇敬！故神威顯赫，香火不絕，遠近善男信女求神問卜頻繁，大帝乩童御神轎，以木擔賜字傳靈方，在浯洲金門少見矣。

附註：部份資料採訪自神譯蔡欽水君(現任瓊林保護廟管委會主任委員暨奠安籌委會主任委員)、神譯蔡益民君，謹此致謝。(本文作者現兼任瓊林保護廟管委會總幹事暨奠安籌委會總幹事，同時兼任瓊林社區總幹事。)