繼而國共內戰，國軍退守金門，二度損壞，半世紀以來兩遭兵燹之災，又呈柱腐樑傾之現象，於民國六十七年戊午再行整修完竣，翌年己未十月十三日彩翬奠安慶典，祈求廟宇永固，合境平安，計支金額貳百貳拾餘萬元，概由華僑及鄉親捐獻，芳名有勒石誌永，以為可保永固，妥奉神祇。詎料又遭蟻蛀，柱腐樑傾，形將倒塌，岌岌可危；恆念葺毀修墜，責無旁貸，爰即召集鄉人共議，原認木材建築易遭蟻蛀，若改為鋼筋水泥，以求一勞永逸，其議固佳，但廟為古建物，歷史悠久，況現正提倡復興文化，維護古蹟聲中，實不宜改變其原有風貌，且其砌牆以玄武岩(米香石)為材，此乃金門尤以本村獨特之石材，外觀雖俗，但有其古樸之韻味，不宜更改，經決議依原狀修復，前落三川門及壁堵、龍虎堵改為石雕，增置石鼓一對、石雕天公爐及自動吸帛金爐各一座，建材以木石磚為主；組成重修委員會，推行各項任務，並擇吉於民國九十年辛巳六月動土，因包商僱台灣泥匠，其施工方法不同，且手藝不精，因而停頓，再行協商。另聘金門泥匠繼續施工，延至九十一年壬午冬始告竣工，雖無雕樑畫棟，飛龍走鳳，仍保有古建物之風貌，而符護古之旨。

保生大帝源自白礁慈濟宮，分尊蒞鄉興宮，廟門前石柱對聯云：「悟道丹成傳白礁；回春法妙濟瓊林。」鄉人未嘗不克進香為懷，故於翌年癸未三月初七日，排除萬難，秉虔誠之心，奉神尊金身赴白礁進香(請火)，祭典依古禮進行，莊嚴隆重，並獻匾一方，中題「慈濟同光」作為紀念；初十日回鑾，并設醮籌神，祈求平安。在此之間，發現白礁慈濟宮所立，清嘉慶二十一年捐緣勒石，有坪林宮認捐，而銀數闕如，因而與該宮管理委員會商議：「癸未年補捐新台幣壹拾參萬元補填之。」以了卻前輩之夙願，而免後人有所歉然，特予敘明。

廟宇主體維修外，并蒙國家公園金門管理處補助整修環境，宮埕鋪設石板，四週行道繞以紅磚；池塘濬深，加圍石欄杆，名曰印月，蓋皓月當空，影印其中，四週燈光投射，清風徐來，流光萬道，碧波蕩漾，身在其中，心曠神怡，別有一番情趣，其領略之。

重修工程已告完竣，美輪美奐，盡復舊觀。此次重修經費，計新台幣捌佰伍拾餘萬元，端賴華僑鄉親及家鄉善信人士輸將與政府補助，暨各委員同心同德，群策群力，有以成之也。捐款芳名另勒石雋永，以彰義舉。欣見廟宇重新，爰為之誌，以冀後之齊美云耳。

瓊林保護廟修建委員會

主任委員：蔡欽水

副 主任委員：蔡能建、蔡金全、蔡顯明

總幹事：蔡青木

副總幹事：蔡群生、蔡清其

委員：蔡炎興、蔡益民、蔡振來、蔡水木、蔡棟、蔡顯思、蔡振智、蔡海南、蔡冬福、蔡振仁、蔡振偉、蔡乃貞、蔡朝岳、蔡福林、莊友第、許金全、蔡志明、蔡錫棟、蔡志孟、蔡金勤、蔡世強、蔡清鵝、蔡錫忍、蘇子雲、蔡炯萼、蔡淵潭、蔡是民、蔡其朝、蔡國鑄、蔡炯華、蔡承揚

名譽委員：蔡承丑、蔡承澤、蔡錫琛、蔡錫洪、蔡端拱、蔡偉卿、周源興、蔡石崇、蔡永堅、蔡主賓、蔡亞例、蔡崑崙、蔡青林、蔡清森、蔡少清、蔡聰源、蔡水才、劉回國

弟子 蘇子雲 敬撰

中華民國九十一年歲次第二壬午年十一月 立。

︿金門縣金湖鎮瓊林里保護廟修建捐款芳名錄﹀

：：中華民國九十一年歲次第二壬午年十一月 立。(略)

舊︿保護廟重修誌﹀

大帝同安人，生於宋太平興國四年，少有異秉，具道性，通歧黃，淡利祿。二十四歲中舉後授御史，辭官歸，結茅於白礁東雁山。景祐間白日升天，屢著顯跡。明永樂太后患乳疾，大帝化道詣闕視疾，以懸線灸治而癒，辭金謝爵，乘白鶴而去，太子知為神醫，爰加封為萬世無極保生大帝，特賜龍袍一襲，建宮殿於白礁東山。

大帝升天後，威靈顯赫，護國祐民，香火鼎盛，每於誕辰，金門香客往白礁朝聖，絡繹於途。本社鄉老虔叩聖駕蒞鄉興宮，蒙恩准聖杯三信，即夤夜恭迎以歸，建廟奉祀，中殿柱石對聯云：「像塑真人位瓊林之寶殿，神尊大帝傳白礁之香煙。」保護廟相傳建於明朝，毀於兵燹，重建於清道光戊申年，凡二進，主祀大帝，配祀恩主及厲王，旁祀水府尊王與註生娘娘諸神，中懸敬山忠義、至誠之道、帝德廣運等匾額，迄百三十年。經宣統二年重修，民國三年奠安，三十七年再行修葺，又逾半紀馨祀，雖弗少替，而已柱腐樑傾，盡失舊觀，風雨飄搖，神靈將安憑式？鄉人咸表關心，爰即召開會議，組成修建委員會，萬事非錢莫舉，除發動地方捐獻，并致函華僑鄉親，呼籲輸將，共襄盛舉，承蒙僑親蔡金情、蔡承丑、蔡錫琛等慨允，捐集台幣壹佰萬元支應，并囑從速進行，爰即擇吉於六十七年三月十八日動土鳩工興建，歷四閱月而工竣，巍峨堂皇，美輪美奐，盡復舊觀。此次重建計耗資壹佰壹拾貳萬元，多賴華僑支援，及鄉中配合與諸委員竭力籌劃，進行相助為理而相與以成之也。捐獻芳名另行勒石以慰僑情，欣見廟宇之落成，聊盡修墜之職，爰為之誌，以冀後之濟美云爾！

瓊林保護廟修建委員會

主任委員：蔡振益

副主任委員：蔡石崇、蔡水福、蔡顯明

委員：蔡金興、蔡金皮、蔡世楂、蔡世溪、蔡承獅、蔡火麟、蔡其溫、蔡水加、蔡根陣、蔡清森、蔡欽水、蔡世強、蘇子雲、蔡振智、蔡後晉、蔡清鵝、蔡朝金、蔡能建、蔡國上、蔡良善、蔡承益、蔡炯萼、蔡其傑、蔡廷銓、蔡青木、蔡金七、蔡佳景、蔡天賞、蔡權鎮、蔡金希、蔡廷青、蔡國財、蔡廷採、蔡炎興、蔡其烈、蔡俊明、蔡樹宣、蔡少清、蔡顯思、蔡新能、蔡錫忍、蔡益民

總幹事 蘇子雲 敬撰

中華民國六十八年歲次己未陽月穀旦立

舊︿瓊林保護廟修建經費樂捐芳名錄﹀

：：中華民國六十八年歲次己未陽月穀旦立。(略)

附註：部份資料就教或採訪自神譯蔡欽水君(現任保護廟主任委員)、里長蔡顯明(現任副主任委員)、鄉老蔡炎興君(現任副主任委員)、鄉老蘇子雲君(本廟顧問)，謹此致謝。(本文作者現兼任瓊林保護廟總幹事，並兼任瓊林社區總幹事。)