一城山色半城湖，四面村舍三面綠。湖畔樓影任徘徊，港灣岩青隨君駐。史蹟此城古，古城文物多。南明遺緒在金門，教化文風揚古城。書味酒香紋寶塔，紅山崗上雲漢影。翟山官路輝古今，燕南祖師共一家。古有書院朱熹來教化，今則古城草堂勤育材。置身古城國小學區，如穿梭在時光燧道，仿古城門牆垣內外，散佈古厝、洋樓、老街及現代建築，寶月泉蘊好酒，工坊酒香高粱，城隍鎮四方，文台護千帆。諺語：「要丁東門外，要富西門外，要興南門外，要官北門外」，流傳至今，昇華四個城門的想像空間，古味悠揚。校區座落於大古崗與金門城交界，得天獨厚擁有金門文化知識寶庫，能內化為該校親師生共學共好教育素材，培育金門文化復古揚新的「點燈人」。沿著東門路旁，矗立「明贈昭勇將軍都指揮僉事，朴庵邵公暨楊氏淑人神道」石碑，及妾身未明的碑石等構件，迎來古城國小入門徑。這是金門第一位「武進士」邵應魁墓園構件。若由北門方向或明遺老街入門徑，是從新文明穿越舊傳統的實境體驗。從校門往左通賢厝、水頭，右往古崗、珠山、歐厝。珠水路如匹練似的迂迴曲折，串連金門城、古崗、珠山等文化幽境，環抱著校區，滋養文化素質。
創校後，大古崗之「古岡學校」，舊金城之「金山中心學校」，與1932年興建於水頭村內的洋樓式「金水小學」，及設於歐厝之「愛華國校」，四角分立，後來經熱心教育人士倡議捐資興學，於現址新建中棟校舍及前運動場，1963（民國52）年完工啟用，首任校長王金錠（50-53）肩負重任，經陳義乞老師建議，奔赴酒廠晉見王多年司令官，爭取解決困難，獲得首肯，親臨擇現址興建校舍，整合為一定名「古城國民學校」，開啟古城國小時代。因金水小學登錄為文化遺產而保留，附近另地興建分校，安置低年段與幼稚園學童（1986後迄今保留幼兒園），愛華分校1976改附屬賢庵國小，這樣校區分散兩地之型制，地區唯二（另賢庵國小附設垵湖分校於后湖）。古岡國校對聯「古博今通振興教育，岡靈水秀鍾毓賢才」，說明其教化精神，具教育史價值而保留。楊太平（53-54）、盧金龍（54-58）繼之，直到第四任許丕府校長（58-68）之後迄今，諸校長均需督導兩個校區，幸而老幹堅挺，新枝煥發，教學團隊專業成長，成效優異。最特殊者是從農工職校借調盧兆睦主任主持校務一年（74-75），創地區從高級職校教師調派國小校長先例；另孫麗琪校長（111.8.1-112.7.15）受陳福海縣長重用，由國小校長提拔高升為第一位女性教育處長，校務委由董麗芬主任代理（112.7.16-113.7.31），這也是金門教育史創紀錄。再遴選薛奕龍校長（113.8.1-），以其本土語言專長，並在國立清華大學金門中心「跨院國際博士學程公共政策與教育組」進修博士學位，帶來新氣象。從李仁木（97-101）起，之後董國正（101-105）、楊成業（105-111）等三任校長相繼在古城實現自我榮退，為自己公務與教育生涯劃下句點。董校長榮退時服務滿四十年之陳耀明主任、主計毛安輝等三人同時榮退。楊瑞松（75-79）、楊肅正（79-82）、鄭藩志（821-87）、莊聰榮（87-90）等四位校長均為正常的四年至八年再榮調他校。2017號稱「十項全能」的校工，服務超過24年，師生口中的「錢爸」（錢發達）退休，送別場面感人，最能體現古城校園的溫馨友善。民國86鄭藩志校長授權活動力十足的輔導組長倪振瑞，笑如彌勒佛般具有感染力，爭取到縣議員許華玉帶頭作用，積極投入召喚家長，籌組「愛心媽媽志工社」，由18位創社擴展至60多位；組織擴大了，因學區分散，為使服務貼近需求，設置前水頭、金門城、古崗等三區組長，更為周延。2018年起創辦「金愛獎」，激勵熱心家長涓滴匯聚，學習成長，故從鄭藩志以降諸校長任內，「愛心媽媽社」是最優異之校園志工團，歷年社長包括許華玉、蔡碧華、陳惠珠、楊麗娟、許麗珠、黃金玉、董婉君、周手治等，不僅成為古城國小最堅實後盾，更是最美麗的名片。李仁木、董國正、楊成業三位校長拓展校區空地，闢建「開心農場」，種植向日葵、洛神花及蔬菜等，食農教育外一章，親師生樂陶陶。由政治大學創新與創造力研究中心為偏鄉教育興辦之「鹿樂」平台，2019閱遍古城校園後寫下「開心農場裡，孩子們親手種下的青菜隨風搖曳；操場上，以獅鼓為原形設計出的遊樂器材佇立。在這純樸的小校，孩子們多方嘗試，快樂成長」，印證校園俊美秀麗的鮮活影像。
歷任校長暨教學團隊長年推動閱讀、品德教育、藝文深耕、本土語言教學、雙語教學等課程，親師生致力於經營友善校園，深具特色。2025推動"開心閱讀、快樂表達"，成效顯著，吸引「台灣偏鄉兒童教育基金會」賞識，拍攝校園紀錄片表彰。薛奕龍校長更以《石獅爺的守護》主題設計本土語教學計畫，榮獲優良教案，親身發表與演示，蔚為典範。薛校長總結該校是「課程發展多元，尋找學生的亮點」，全方位提昇學童人文素養。
民國88年拆除改建中棟教學大樓教室，90年5月12日落成啟用。99年擴建辦公室。幼兒教育起於民國65年，老舊園舍直到107年楊成業校長爭取到8,124萬3千元經費，整建幼教大樓，是建校以來最大的一筆投資案；恰好110學年迎來二歲幼幼班，增添活潑。矗立50多年的北棟教室，禁不起歲月濕潮，有些鋼筋裸露遭列危險， 2024經關心教育的陳福海縣長率員親自履戡，同意超前部署准予先拆後建，打造友善共好的學習環境。校區從此像「聚寶盒」般完整而引人入勝。
吳水澤校長引進，李仁木校長任內積極倡導獅鼓陣，延請教練，大力轉型為「七星鼓舞獅」（腳踏七星鼓，手舉文武獅）藝陣，後任校長持續努力，成為地區繼上岐國小、開瑄國小、寧中小之後校園四大鼓藝陣，經常擔綱各種活動開場，振奮人心。
「燕南山書院」及「古風草堂」，是另創一格的現代化「教育番外篇」（非正規教育體制，自訂規準）。出身古區10號的「遊俠兒」楊樹清催生，在金門縣文化局行政支援下，創設「燕南山書院」，聘其為院長，推廣朱子遺教，倡興「金門學」，具有振興金門文風崇高意義。配合朱子冥誕，循周朝祭天之古禮祭祀，古城國小學童受邀表演獨樹一幟的「六佾舞」，增添書院古風。從軍職榮退之倪振金教授，懷抱琴心劍膽、遠見卓識之氣度與格局，自宅開設義學，並創設以小學生為主之「古風小學堂」關懷下一代，以「忠、孝、節、義、書、劍、江、山」為入學輩份，傳博雅，重實踐，孕育國學素養，振興華夏文化。古城國小恰好共伴，書香弦歌蘊古風，義學書院教育新。2024由教育部資訊科技司資助、台灣大學主辦的「國際學伴」計畫（ICL），該校五年級學生在外師Rylee及Rosslyn指導下，與來自不同國家的學生在線上相遇，不僅提供跨國多元文化學習機會，拓展視野，並且透過線上增進友誼與進行交流。2024國立金門大學電機工程學系與社會工作學系的教授與學生們協助辦理「AI科技體驗營」，初識智能化與數位學習。六年級學生赴城中參訪「區域職業試探與體驗示範中心」，透過體驗實作，增進對工作世界的認識；跟著縣議員董森堡走讀老房子-古岡學校，培養愛鄉愛家沃土；在金門農工養殖科師生協助下，到古崗湖畔放流5千多尾鯉魚、鯽魚、羅漢魚及蓋斑鬥魚等原生魚種，關懷古崗湖生態。嘗試在傳統與現代間架構課程發展，從現代邁向未來化，董麗芬主任主導「書韻飛揚在古城」校本課程大計畫，若能整合周邊資源，增強夥伴合作關係，注入人文教育實驗，具有持續發展性，或能創造教育新格局。
古城國小以本土深耕與創新活化之現代化教育，伴隨書院、義學、國際學伴，四維共構之特色，為全國唯一僅有。古城國小底蘊深厚，立足本土，放眼世界，薛奕龍校長認為「教育是生命感動生命，生命影響生命的美麗過程」，古城帶領的學童，如天蠶再變，鮮活的推演「生命感動生命，生命影響生命」的美麗篇章！