今年度開始，金門地區也開始試辦高中職免試入學，高中職免試入學方案係教育部基於國中基測實施迄今雖已近十年，但是各種多元管道仍以國中基測量尺分數作為分發篩選之重要依據，多元能力評量參採比重偏低，國中學生升學競爭壓力未得紓減，學生未能適性選擇高中職就學等問題，原來期以國中基測作為入學門檻，申請入學導引適性分流，多元管道實現多元選才等理念，未能完全體現，為能給予每位學生優質的教育環境，多元適性的發展。因此，以漸進彈性、因地制宜等原則，穩健逐步調整多元入學方案，建立適合各地區國中學生的升學方式。其次是教育部為推動十二年國民教育的終極目標，遂以逐年提高免試入學比率的方式，來推動十二年國民教育的全面實施。
紓緩學生升學考試壓力、發展學校辦學特色、全面關照不同地區學生，縮短城鄉教育落差，高中職免試入學立意雖佳，但地區今年度這項擴大試辦高中職免試入學，由於籌備匆促，在整個方案的擬定和討論，也有不夠周全的地方，像金門高中給國中每班三個免試入學的名額，不論每班人數多少，均是三個名額，對一些班級人數較少的學校當然有利，但對一些班級人數較多的學校如：城中，就有些不公，因為城中每班人數多達三十二、三人，而其他學校每班人數廿餘人，卻同樣給予三個名額，這是齊頭式的平等，而非立足點的平等，此一現象雖迭經城中的行政、教師會和家長會代表在多次的會議中反映，仍然無法改變既定的事實，雖然主辦單位強調明年會再檢討改進，但是一項制度的建立，如果剛開始無法樹立公平公正可長可久的的規則，恐怕以後會招致家長抗議；另外除了每班三位高中名額，高職則給每兩班十一個名額，這樣平均每班就有約八個人，若在三月底前錄取後報到就形同提前畢業，當然理論上來說，申請到免試入學的同學，也必須讀完國三下學期所有課程才能畢業。但人性總是好逸惡勞，容易鬆懈，如果要這些篤定可進入高中或高職的同學，要和要拚基測的同學一起保持高度的備戰狀態，一起考複考、模擬考，不僅困難，而且也易造成國三老師在教學和管理上的困擾。因此教育當局和學校應及早擬定對策，讓這些已篤定上高中、高職的學生，除了和班上考基測的同學一起上三下的正常課程之外，特別在國三課程上完之後到第一次基測之前，國中有無可能為這些學生安排一些服務課程、技藝學習，甚至英檢訓練班，以彌補他們的學習空窗期，或是高中職是否有可能開一些銜接性質的先修或預修課程，讓這些學生預先體驗高中職的學習生活，為未來的學習生涯作好準備？近幾年從大學到高中職多元入學方式的實施，的確讓教育的進路產生了百花齊放、多采多姿的景象，學生的生涯進路也多了很多機會，但誠如一位高中家長所言：現在這種多元入學方式因為要錯開，而產生較長的辦理期程，無形中也壓縮了學生學習的期程和內容，如不好好處理，對我國中學生和大學生的素質產生一定程度的影響，這是整個地區教育當局、學校和家長不得不正視和集思廣益、設法解決的問題。