冷戰結束後，中共擴大崛起，對亞太地區的影響力，與日俱增，而美國為維持其「超級強國」的獨霸地位，必須遏制中共的過度擴張，因此有了「重返亞太」的戰略構想，此一戰略構想，雖一度因恐怖主義之興起而略有調整，但隨著伊拉克戰爭的結束及賓拉登的死亡，又加快了執行的步伐，其主要部署在東北亞乃結盟日本，在東南亞則拉攏越南，同時建構以關島為中心的「第二島鏈」防衛體系，期連結太平洋、印度洋基地群，以有效遏止中共的擴張。
而在這個過程中，臺灣的角色似乎被淡化了，尤其2008年後，因國民黨勝選，兩岸關係大幅改善，一方面臺灣並不熱衷於參與美國對中共的「隱形圍堵」；另一方面美國重返亞太所擇定的結盟對象，與臺灣皆有領土主權的爭議，東南亞的越南是太平島，東北亞的日本則是釣魚臺，在這兩個小島的主權爭議中，美國基於其亞太利益之考量，是不可能公開支持臺灣的。
其中太平島孤懸於臺灣1800公里之外，超過台灣目前所有戰機的作戰半徑之外，鞭長莫及，固守不易，一旦有事，只能孤軍奮戰，目前覬覦太平島最熱切的國家首推越南，年來已有多次侵犯我警戒水域之紀錄，平心而論，在詭譎多變的南海水域中，兩岸間若無某種合作默契之存在，太平島只怕無法固守至今；至於釣魚台距離臺灣雖然近在咫尺，卻因美國將行政管轄權移交予日本，使得臺灣的主權訴求受挫，連帶漁權談判也跟著受阻，在兩岸關係緊張之時，臺灣對釣魚台的主權訴求只能忍氣吞聲，但在此兩岸關係大幅改善之際，「兩岸聯手保釣」遂成為臺灣可資運用的戰略選擇。
雖然以目前的態勢觀察，兩岸或許無法一下子走到「聯手保釣」這一步，不過無疑的日本此次將釣魚臺「收歸國有」的政策，已逼得臺灣不得不向中共做某一程度的靠攏，而其呈現之方式，有時並不是以釣魚臺事務為限。
金門自大陸引水之議題，在臺灣政壇已喧騰多時，然始終未有進展，在釣魚臺事件之後，大陸海協會會長陳雲林於訪金時表示：「希望兩岸接水議題應快速推動。」這是大陸主管兩岸事務最高首長首次對金門自大陸引水政策的明確表態，陳會長顯然也看出此一事態之發展，希望藉此促成兩岸關係的更緊密安排，值此海陸兩會易長，展佈新猷之際，金門自大陸引水之議題是否能順利推動，不僅是考驗新人新政的試金石，更是馬總統堆高歷史定位的里程碑，值得吾人寄予深切之厚望。