北、高市長及市議員選舉落幕。從市長選舉結果來看，仍然是北藍南綠的格局，雙方算是平盤之勢。只是陳菊在高雄險勝，有人單純地解讀為阿扁牌的效應，卻忽略了民進黨人大團結的因素。而國民黨黃俊英落敗，馬英九個人及黃俊英陣營成為眾矢之的；小馬哥更受到黨內一些所謂「本土」勢力的責難，以及愛之深的一些泛藍民眾對他怯懦的個性及領導風格表示不滿。沒有人因為他以一己之力與候選人單打獨鬥，面對的是民進黨人以打群架之姿在打選戰而給予掌聲，一場選戰打下來，馬英九傷得不輕，民調支持度也呈下滑之勢。

這次北、高兩市的選戰，馬英九犯了明顯的戰略錯誤，在其不能從南北選民結構的差異去區隔選戰主軸，將選戰定位在「對陳水扁的不信任投票」或「對馬英九的信任投票」，根本是不瞭解高雄市泛綠選民心理。即使阿扁執政多麼無能，貪腐無狀，國家沉淪到如此不堪的地步，但是只要提到要捍衛「本土政權」，這些綠色的票就會力挺到底。其次，馬、黃二人隨機應變及危機處理能力不足，也是敗選的重要因素，在選舉活動停止後、投票日的前一夜，敵對陣營操弄走路工的賤招，地下電台、親綠電視台一再重複的播出，投票日阿扁還放話企圖影響選情，馬英九則以文謅謅的語氣回應，毫無強烈的反擊力道，所以，千餘票飲恨，一點都不冤枉；事後再要求法院封存選票、打選舉官司，只是「狗吠火車」，無濟於事。

面對2008年總統大選，馬英九還有很多功課要做。如果他不能從歷年來民進黨打選戰的手法，尤其是1998年高雄市吳敦義與謝長廷之戰、2004年「三一九事件」及這次黃俊英敗選的慘痛經驗中學到教訓；如果他不能認清民進黨打選戰，在極度不利的情況下，如何以詭詐的「奧步數」，不擇手段的求得勝選；如果他仍然存著要打高格調選戰的君子之爭，不知道選舉如同作戰，戰略目標要明確、政見政策要具體、戰術手段要靈活，並運用兵法上的奇正之變，擬訂完善的作戰計畫及緊急應變措施，則將難以取勝。尤其民進黨執政在手，這幾年在黨、政、軍、特各系統，必然蒐集了政敵的一些「黑資料」，大選一到，拿來抹紅、抹黑、不實爆料，弄得對手難以招架，防不勝防。例如這次國務機要費承審法官之一的張熙懷，被民進黨立委林國慶抹紅，所爆資料從何而來？明眼人一看便知。

馬英九的困境與危機來自兩個方面。首先，他從政以來，自政務官到民選首都市長，一路走來，高人氣維持不墜，2005年底「三合一」選舉，為國民黨帶來亮麗的成績單，人氣指數達到巔峰。但是，今年五月國會「罷扁」或「倒扁」遲疑不前，及面對九月「紅衫軍」倒扁以來的「法匠」作為，又因市長特別費風波，以及北高市長選舉結果不如預期，政治光環日漸消褪。尤其是，少了市長的行政資源，專任黨主席之後，馬英九如何在民進黨執政成績不彰的情況下，積極地為國民黨的改革進步拿出具體行動，並為台灣的未來提出讓民眾可以信服的政策與前景，讓選民認同其治國能力，取得選民的支持與信任，才能維持高人氣不墜，為2008年進軍總統府奠基。

最主要的難題，是馬英九將如何統整泛藍的力量，讓自己成為泛藍的共主。他必須妥慎因應來自連戰、宋楚瑜、王金平等三股力量的挑戰；說穿了，就是安內攘外，面對黨內舊勢力虎視眈眈、伺機奪權，外有敗選後的宋楚瑜動向不明，國親聯盟能否成真？做到外界所謂「尊連、撫宋、拉王」的期望，這些都考驗著馬英九的政治智慧與能力。而在處理內部問題的同時，也考驗著馬英九如何調整其人格特質及重塑其領導威望與危機處理的能力。為了適應台灣特殊的政治環境，要進取大位，馬英九應該思考，怎麼讓自己深化「在地」的「本土味」；同時在溫良恭儉讓的個性中，加入一些「有魄力」的領袖特質，以達政通人和之境。