雅加達（又稱椰加達、椰城、吧城，以下簡稱椰城）位於爪哇島的西北濱海岸，是印尼的政治、經濟、文化中心（2024年起，印尼政府擬將新首都遷往婆羅洲東加里曼丹）。印尼人口約2億6000多萬，其中約三分之二集中在爪哇島上。椰城人口超過1000萬，加上近郊通勤的人數，都會區域達3000萬人以上。
1619年，荷蘭人曾征服了這座城市，並命名為巴達維亞（Batavia），成為荷屬東印度總督駐紮的首府。荷蘭殖民治理，促成了這座城市的商業機會，也吸引中國移民的到來。
目前的田野調查資料顯示，印尼的金門社群一開始並非聚集在椰城，而是在「外島」（如邦加、勿里洞、東加里曼丹等）或其他城市（如泗水）發跡後，才遷居首府。1990年新加坡金門會館出版的《亞洲金門同鄉通訊錄》中一篇文章提到：「大概在1939年前後，椰城的金門僑胞成立了金門同鄉會。其時，椰城的金僑寥寥可數，參加的會員不過三十人而已。這組織辦事處附設在福建會館，因無會所，所以無甚活動。首任會長是王金城，陽宅人。」上述的引介，除了王金城的祖籍地並非陽翟、而是后宅之外，大致上正確地說明了椰城金門鄉僑的狀況。
金門同鄉會成立3年左右，日軍佔領荷屬東印度。會務因此停頓，椰城「金門同鄉會」形同瓦解。1945年日本投降後，旅外鄉僑覺得有必要重建組織，遂發起籌組行動，並命名為「金門會館」，時間上從1945年開始籌備，到1953年正式成立，第一任會長王仁忠（祖籍后宅）。「日本投降後，鄉人洪文賢、呂清淮等人重行發起組織，取名為金門會館，重新登記會員，人數比以前增多，組織也比以前完善，不僅設章程，有宗旨，也自置會所辦事。後因不敷應用，乃集資購置舊旅館於椰城太史廟街準備籌建會所。這期間，領導金門會館的是王仁忠（1953年至1964年），幹事為洪文賢、呂清淮，文書由呂清淮（兼），並聘請許可為座辦，福利則為陳延壽。（《亞洲金門同鄉通訊錄》，頁110。）
然而好景不長，1965年印尼嚴重排華，華人社團受到壓制，椰城金門會館被迫關閉，相關資料也佚失。1985年左右，政局較為和緩，印尼當局放寬對華人的限制，加上印尼群島各地金門鄉親紛紛自其他城市、小島遷徙至椰城謀生，據估計有2千餘人；因此，在眾多金門鄉親的發起下，由陳延壽、張德超、許丕田、黃進益、唐乙丙、許天鳶、黃章掘、呂承慶、陳漚乾、周水贊和楊子民共11人的聯名，向政府註冊「金門互助基金會」。
是故，「金門互助基金會」於1986年4月9日正式成立。旨在謀求會員福利，強調敬老尊賢和扶危濟貧的精神，並設立助學金，以鼓勵莘莘學子向學。同時，也多次舉辦體育、音樂等有益身心的文娛活動。半年後，購置兩層樓會所於珊瑚新村。1988年3月，該會理事決定斥資2億3千萬盾購置鬧市中心旗杆街54-22的四層樓大廈為新會所，至此，印尼金門同鄉乃有了聯絡情誼和溝通訊息的場所，也在其他地方設置各區聯絡站，如1987-89年間，在坤甸、中爪哇、勿里洞、山口洋、泗水等地。
2001年，在椰城金門互助基金會成立15週年的慶祝大會上，吸引了東南亞各地的金門同鄉團體組團前往祝賀，其中包括由（已故）方水金所率團的新加坡金門會館。至2017年，會員已有800多人。2018年金門互助基金會總主席黃進益（祖籍西園）辭世，改由陳火進（祖籍陽翟）擔任總主席。金門互助基金會不僅與僑鄉金門保有聯繫，也常接待來自新加坡、馬來西亞等地的金門同鄉團體的拜訪，交流相當密切。每屆世界金門日，椰城金門互助會經常組團參加慶典，同時也協助印尼金門鄉親回鄉省親各項事宜。
從1939年的金門同鄉會、1953年金門會館到1986年的金門互助基金會，椰城的金門鄉親走過二次大戰的艱苦、政治上排華的壓迫等歷程，但始終沒有遺忘鄉情，持續建立緊密的地緣網絡與互助系統，即使在海外落地生根，但也不忘以金門為名，持續傳承文化。