金門人渡過黑水溝往台灣遷徙的移民史，除國共內戰時期之外，至少在明清之交亦曾經歷過一波高潮期。依相關史料考察，明永曆十五年（1661年），鄭成功親率大軍自料羅灣揚帆出海展開復臺之戰，以勤敏才略為鄭成功所倚重的蔡政即是金門人，也因此目前在金門尚留有國姓井、鄭軍銅砲、觀兵弈棋處及吳山頂上的烈嶼巡檢司城等多處古蹟。
自此而後，隨著征戰軍旅而陸續依親移居台灣的金門人不絕如縷，「開台進士」鄭用錫（1788－1858年）亦為金門籍，「開澎進士」蔡廷蘭（1801－1859年）同係金門移民的後裔，現今鹿港與艋舺仍留有金門會館的古蹟，新竹市也有所謂「金門厝」的地名。事實上，金門與台灣的關係，從明、清開始的近六個世紀以來即相當地密切。
但因囿於古代不具備遠洋撈捕的技術與黑水溝海域的寬闊與險峻，在38年揭開國共冷戰格局之前，順著大陸沿海「落番」南洋的原鄉人仍佔多數。其間，加上橫跨元、明、清三個朝代以來各種形式的海禁政策（又稱洋禁或鎖國政策），以及1895年4月17日馬關條約將臺灣割讓予日本，種種原因都限制了早期移民台灣的鄉親子弟回訪金門。
解嚴以後金門開放觀光，這些鄉親子弟紛紛透過各種管道踏上母島尋根問祖，但有些人或能如願得償，更多的人卻只能無語問青天，因為幾代斷絕的時空實在隔離得太久了。然而，不僅如名作家馬奎斯說：「一個人若沒有他的親人埋葬在他所生活的土地，他就不是屬於這片土地的人」，即便是遷居台灣的先人入土墓碑上鏤刻著「金門」二字，他們總還是不否認係屬於這片土地的人，這便是鄉親血緣與認同不斷的最佳詮釋。