金門縣立醫院自七月一日起實施健保卡第二階段寫卡作業，意即民眾看診後仍需再排一次隊完成IC卡結帳寫卡作業，也因此造成昨天上午掛號人次高達五百人，現場大排長龍，民眾抱怨連連，院方緊急增派掛號批價人手因應，同時積極接洽資訊合作廠商修改程式，可望儘速改善民眾就醫之不便。

健保局規定自九十四年七月一日起，醫院需將民眾就醫之用藥、門診其他醫令、主次診斷、電腦斷層檢查、就醫費用、住院手術等醫療資訊寫入健保IC卡，民眾持卡至其他醫院就診才可讀出IC卡記載之相關就醫記錄，此舉是為了能讓民眾的就診資訊能在醫院間分享，也可避免重覆開藥檢查等醫療浪費。

民眾於台灣各醫院看病時，因要負擔部份負擔費用，所以掛號時要排一次隊，繳部份負擔又要排一次隊，掛號批價要排兩次隊已是常態，但民眾在金門醫院看病不需部份負擔，除了掛號排一次隊外，看完診直接藥局領藥就可離開。為配合健保卡第二階段寫卡作業，自九十四年七月一日起，民眾看診後仍需再排一次隊，才能完成IC卡結帳寫卡作業，造成民眾不便。

縣立醫院指出，由於七月一日及二日看診人次不多，IC卡結帳寫卡作業影響不大，七月四日上午掛號人次達五百人，每人排兩次隊，等候時間加長不少，造成民眾極大不便，怨聲四起；醫院即日起先增派掛號批價人手，期使民眾等候時間能夠縮短，另積極接洽資訊合作廠商訊翔公司修改程式，把結帳寫卡作業分散於各診間，希望能減少民眾就醫之不便。