金門國家公園委託研究團隊進行各濕地的鳥類調查，經三年調查研究，金門地區的浯江溪口、慈湖、后江灣、陵水湖等濕地提供水鳥遷徙時所需的休息及覓食需求，是水鳥的重要棲地，而慈湖、官澳、西園與少數未被淹蓋的潮間沙洲與礁岩則是水鳥在滿潮期間主要休息地。其中優勢鳥種包含東方環頸鴴、黑腹濱鷸、鐵嘴鴴、黃足鷸、翻石鷸等。
金門位於東亞地區鳥類遷徙途徑上，因人口密度低，開發程度低，故保有豐富鳥類資源與多樣棲息環境。金門國家公園管理處為瞭解金門水鳥的生態行為及遷徙路徑，推動水鳥保護，擬定遷徙水鳥及重要濕地生態保育策略，自101年起委託國內鳥類研究權威劉小如教授及台灣水鳥研究群研究員蔣忠祐組成的研究團隊，進行「金門水鳥遷徙生態調查」研究案。
金管處表示，經三年的調查研究發現，浯江溪口、慈湖、后江灣、陵水湖等濕地提供水鳥遷徙時所需的休息及覓食需求，為重要棲地；慈湖、官澳、西園與少數未被淹蓋的潮間沙洲與礁岩則是水鳥在滿潮期間主要的休息地。前述濕地也是保育類鳥種黑鸛、東方白鸛、黑面琵鷺、白琵鷺、唐白鷺、大杓鷸、琵嘴鷸、諾氏青足鷸、黑嘴鷗、燕鴴度冬、過境與繁殖期的棲地，許多鳥種也連續三年都穩定出現，顯示該濕地對水鳥及保育鳥種之重要性。
而研究團隊也利用水鳥繫放、足旗觀察、衛星追蹤等技術，瞭解金門地區水鳥的遷移路線發現，金門地區的水鳥主要是冬季棲息於澳洲西北部、東南部等地區的水鳥在遷徙季節重要的過境地區。
另於兩隻大杓鷸及三隻中杓鷸身上安置衛星發報器發現，地區度冬的大杓鷸與中杓鷸會在四月初與五月初開始往北遷徙，途經大陸沿海經過渤海灣後進行第一次能量補充，然後切入內路往北前往西伯利亞繁殖地，繁殖地均接近極圈一帶。
金管處指出，金門擁有良好的濕地環境，提供水鳥棲息覓食，部分保育類鳥種極少現蹤台灣，在金門卻每年發現蹤跡，顯示金門地理位置與濕地環境的重要性。為加強宣導金門候鳥遷徙的重要地位，該處還拍攝「南遷北返‧金門鳥類生態」影片，以進行環境教育，該片也獲得第四十六屆休士頓影展白金獎的肯定。