在金門現存的11種無形文化資產當中包括瓊林蔡氏家廟祭祖儀典、四月十二迎城隍、金門風獅爺、普渡燈、中秋博狀元餅、后湖卯年海醮……等，當中有7種的辦理週期為每年、8種有固定的辦理地點、9種屬於民俗類。不僅展現地區傳統文化、地域特色，更豐富居民文化生活。然而，金門無形文化資產在保護和傳承方面也面臨著一些挑戰。
首先，在傳承與斷代方面。隨著時代的變遷，一些金門無形文化資產的傳承人逐漸老去，後繼無人，面臨傳承斷代的危險。例如，金門的傳統建築技藝主要由老一輩的工匠傳承，隨著他們年齡的增長和退休，傳統建築技藝的傳承面臨著嚴峻的挑戰。
次則，在商業化的影響下，一些金門無形文化資產逐漸失去其原本的內涵和價值。例如，金門成年禮與喪葬禮俗活動，原本是金門人民非常重要活動，但在商業化的影響下，一些儀式的簡化，甚至逐漸演變為旅遊商品，失去了其原本的歷史意義。
第三，外來文化的衝擊。在全球化的背景下，金門無形文化資產面臨著外來文化衝擊的影響，需要不斷強化自身的生命力。例如，在西方文化的影響下，一些金門的傳統節慶活動逐漸淡化，取而代之的是西方節日。
最後，保護與資金不足。金門縣文化局在無形文化資產的保護和傳承需要大量的資金投入，而目前金門的文化保護資金投入尚屬不足，制約了現存金門無形文化資產的保護和傳承工作。
針對四項挑戰，總體上急需採取切實有效的措施，加強對金門無形文化資產的保護和傳承，特別是具有地方特色文化資產的未來，大致上努力與發展的方向可歸納為六點。
首先，傳統文化的保存方面，金門無形文化資產大多具有悠久的歷史傳統，是金門民間文化的重要組成部分，對於保存傳統文化具有重要意義。
次則，在離島特色的展現，金門無形文化資產具有鮮明的地域特色，反映了金門獨特的自然環境、歷史文化和人文風情。
第三，豐富生活與文化。金門無形文化資產豐富了民眾的文化生活，如農曆四月十二日迎城隍、中秋博狀元餅、普渡燈、烈嶼成年禮、虎爺咬菜碗……等，增強了民眾的在地文化歸屬感和認同感。
第四，反映戰地與歷史變遷。金門無形文化資產也反映了金門歷史變遷的軌跡。例如，金門的戰地文化遺產，如坑道、碉堡等，就反映了金門曾經作為戰地島嶼的歷史，也反映了金門人民在戰爭時期的堅韌不拔的精神。
第五，融合閩南、僑鄉多元文化。金門地處閩南沿海，自古以來是閩南文化、海洋文化和中原文化交匯融合之地，因此金門無形文化資產也呈現出多元融合的特色。例如，金門的祭祀儀式既保留了閩南文化傳統，又融合了中原文化的禮儀。
第六，展現源源不斷的生命力。金門無形文化資產非一成不變，而是具有生命力的。隨著時代的發展，金門無形文化資產也在不斷演變和發展。例如，金門的傳統燕尾馬背建築，在保留傳統風格的基礎上，也融入了一些現代元素。
最後，文化局得更進一步加強宣傳教育、研究調查、保護管理、人才培養與國際交流。首先在宣傳教育上，得透過各種途徑，提高社會公眾對金門無形文化資產的認識，增強保護意識和傳承責任；次則在研究調查上，可深入挖掘金門無形文化資產的內涵和價值，建立健全保護和傳承機制；第三在保護管理層面，應制定和完善相關法規，加強對金門無形文化資產的保護管理；第四在人才培養上，培養和造就一批行政專業人才，為金門無形文化資產的保護和傳承提供人力保障；最後對外的交流，可加強與海內外相關機構的交流與合作，促進金門無形文化資產的保護和傳承。