本屆立法委員選舉期間，國民黨組發會成立「選舉奧步研究所」，專門研究歷次選舉民進黨的負面選舉招數，公布了十五大類選舉奧步計一四三項「爛招」，自認在選戰中可以見招拆招，快速反擊。細看這份對民進黨負面選舉方式的內容，從蒐集、歸納、整理、分類，其流於形式，虛應故事地列舉項目，無助於應付對手變幻莫測的選舉招數。再從這次總統大選雙方陣營的成員觀察，馬英九本身樸拙直率，個性謹小慎微，其團隊以學者或技術官僚為骨幹，大都過於老實或墨守陳規；謝團隊則以民代背景出身，屬機巧善辯之輩，尤其謝長廷在民進黨素有「小諸葛」之稱，亦為其競選搭檔蘇貞昌口中的「奸巧」之徒，樸拙者遇上奸巧之徒，常常要吃悶虧。

馬英九之所以漸入險境，指的是其選情及人身安全兩方面。從選情觀察，民進黨必然集府、院、黨之力，動用行政資源全面拉抬謝、打擊馬；以阿扁為首的總統府，將繼續推動「入聯公投」議題，不惜造成國際關注、兩岸緊張以激發民粹，並以中選會操弄公投綁大選方式攪亂選情；行政院由張俊雄繼續領軍，延續「一周一利多」作法，亂撒國庫的錢行政策買票的勾當，並動員國營企業為謝長廷大力輔導；黨的組織則在謝長廷代理主席與其競選團隊結為戰鬥體，正面迎擊馬陣營的挑戰；因此，民進黨係傾府、院、黨之力分進合擊，謝長廷選情將漸入佳境。

在馬陣營方面，自黨內初選勝出以來，靠著個人的政治魅力，深入民間，走訪基層，呈現獨力作戰之態。國民黨對他助力有限，壞事的倒是不少；就如此次立委大勝，就有犯了政治大頭病者，去幫信用掃地且立委敗選後處於苟延殘喘的權力者加持；外界對「扁吳會」毀譽參半，但是，最要命的是，這個密會，刻在南部「疼惜台灣行腳」的馬英九，是媒體追問下才知情，顯見藍營馬總部與黨中央以及國會龍頭等三方面均未整合，造成一人一把號，各吹各的調，授予對手分化藍營的可乘之機。這件事的後續效應難料，從阿扁以往紀錄觀察，選戰到最後一天，假設阿扁胡亂編造說這次密會，是王金平與吳伯雄挾國會多數要脅，去為馬英九或吳自己爭組閣權被他所拒絕，到時候各說各話，王、吳二人即使跳到黃河都洗不清，果真如此，將重傷馬的選情，陷馬於險境。

其次，國民黨似乎沒有從2000年「興票案」中學到教訓；同時，馬英九也沒有從「特別費」案危機處理及應變能力不足的慘痛經驗中學習成長。「奧步研究所」研究了大半天，但是當謝長廷拋出「綠卡」問題，未看清楚對方拳路，反應不及即胡塗接招，折損自己的誠信，更再度暴露馬團隊欠缺危機處理能力的弱點。須知，謝長廷這次只不過牛刀小試就輕易得分，把馬團隊修理得陣腳大亂；接下來，以民進黨集黨、政、軍、特（情治）系統蒐集的資料，每日一「爆」就可以搞得馬陣營人仰馬翻，那裡還有餘力去打選戰？反正「死豬不怕水燙」，謝長廷用這些買空賣空的招數，只要能造成馬英九失分他就有賺，何樂而不為？

另者，坊間暗殺候選人傳聞甚囂塵上，勝選希望讓各方看好的馬英九，其人身安全倍受關注。一般言之，馬英九人身安全指數將與其聲勢成正比，亦即聲勢愈好，則危險指數愈高；尤其是，三月廿二日馬如順利勝出，在五月二十日就職日前，更是其人身安全的高危險期，也是觀察阿扁是否心甘情願交出政權的重要指標。此外，根據國安局對派出的總統候選人維安特勤組之要求事項中顯示，馬英九自登記日起，其行止均在國安局的掌控中，這裡面的玄機，值得馬陣營嚴肅以對。

謝長廷曾說「要打一場優質選戰」，一向主張打高格調選戰的馬英九信以為真，豈料會掉到「綠卡」的扒糞漩渦？謝也曾說「要打得對手爬都爬不起來」，於今觀之，在民進黨府、院、黨聯手合擊下，馬英九得嚴加防範對手卑劣的負面選舉奧步。尤須強化危機處理與應變能力，否則，稍有不慎，將被打得滿地找牙。