《愛吾廬筆記》三卷──上卷、下卷、續卷。這是一部學術的筆記，是呂世宜讀書、讀經的筆記。其內容有經義考校，文字考釋，引經據典，採諸家之說，以釋經義，分辨正訛，以訓詁正經史。楊雪滄（浚）說，他知道這本筆記很久了，過廈門屢訪之不獲，丙子（光緒二年）得見《愛吾廬筆記》抄本。書中雜舉經說，偶及小學，大抵隨筆採摭，與義門讀書記相似。
《愛吾廬筆記》是呂世宜平生研讀經書、釋字說文的心得，成於日記，隨手筆錄，經年累月而成書。一書共三卷編為三冊，刊刻於道光二十八年（1848），陳慶鏞撰「序」、莊中正撰「書後」、林樹梅撰「跋」。2003年我研究呂世宜，寫論文《呂世宜學風格研究》，其中曾說《愛吾廬筆記》是西村所撰，今未見其書，臺灣找不到。該書現在收藏於廈門市圖書館，清道光二十八年戊申「以古為鑑之齋」刊刻本，一函三冊。今年六月，我特別請廈大何秉仲教授幫忙，得到廈圖陳紅秋主任的許可，張文杰載我到體育路，直入廈門文化藝術中心廈圖新館的特藏室，把《愛吾廬筆記》刻本調出來，仔細批覽，並照了幾張書影、內頁，總算有緣一見此書在這許多年後。
同年友陳慶鏞撰其序：西村考經釋字，實事求是，獨闢己見，補所未備。其辨認古籀，則直追倉、史源流，折衷貴當，能發六書神旨。西村精篆隸，嘗手摹漢碑數十種，刊石行世，得之者珍如拱璧。家居著書自娛，不肯妄投一刺，鄉里重之，尤為同譜中所欽敬。
好友莊誠甫（中正）撰其書後：漢學之明，我朝為盛。西村《愛吾廬筆記》中解字則以《說文》為宗，考經則以《四書》先聖之言為主，不苟同，亦不立異，皆數十年會心有得。因書於後，以志欣慕之私。
同鄉好友林樹梅撰其跋：先生授徒鄉里，以高致稱。嘗自題家中兩壁：「讀書宜略識字，立品只爭為人。」故其著作說經、說字，一皆根求理要，必考諸古，而不囿于古。往歲海氛，避居江滸，益以金石圖史自娛，種竹栽花，不入城市。樹梅一再訪之，因出是編，屬校字。念在先生與樹梅同里居，又是同學，於是卒讀先生之著，愈服先生之讀書立品成其高致。
西村〈愛吾廬〉著述有三種：《愛吾廬文鈔》、《愛吾廬筆記》、《愛吾廬題跋》，另外出版的還有《古今文字通釋》十四卷。在〈呂西村自作墓記〉中：「刻文鈔六十餘篇、筆記三卷貽人」。據金門縣志載：「西村著：愛吾廬文鈔三卷（應作一卷分上中下）、筆記二卷（應作三卷）、愛吾廬題跋一卷（不分卷）、古今文字通釋二十四卷（應作十四卷）」，記載有出入，正確應依〈呂西村自作墓記〉之說。新《金門縣志》重修時尚未依此勘誤。其中寫呂世宜的傳記略見簡單，西村的金石書學聞名於兩岸三地，書寫風格影響閩臺甚鉅；文學著作甚豐，清末就已刊刻出版。各種著作的卷數我也發表多次，為何還老守舊誌材料不改？〈呂西村自作墓記〉這一篇也應該收錄在縣誌裏，何況這方陪葬的「墓記硯」，在廈門出土，現在收藏於金門，縣誌應該要記錄。