因應新冠肺炎疫情持續升溫，為防群聚感染，考量集會活動通常人潮擁擠，長時間且近距離接觸，具有高度傳播風險，一旦出現疑似個案或群聚事件，將提高防疫難度，中央流行疫情指揮中心宣布，自3月25日起，室內超過100人以上、室外超過500人以上之公眾集會活動建議停辦，以減低社區感染的風險。
清明節將近，外界擔心祭祖將成為防疫漏洞。縣殯葬所在本縣仙洲福園納骨塔及各民眾公墓，為全面配合中央防疫政策，有關清明祭祀掃墓業已自3月14日起至4月12日止，每日上午9時至下午16時全面提供服務，配合鄉親辦理掃墓，以表達對祖先慎終追遠之思念，確實紓緩清明期間之祭祀人潮；於4月2日至5日清明連假期間，該所於各民眾公墓將提供各項清掃用具供應，並放置金爐或燃燒金紙用鐵桶供掃墓民眾使用，掃墓鄉親可逕向各公墓服務人員洽用；暫不開放鄉親進入納骨堂祭拜，僅開放塔外廣場設置祭拜桌，供鄉親祭祀祖先，並於廣場前方入口安排人員測量額溫及檢查是否配戴口罩，未配戴口罩或有發燒症狀者一律不得進入廣場。同時該所官方網站金門縣仙洲福園業已建置電子追思網，旨在推廣節能環保，以網路直播方式參與，或者在線上追思祭拜，請鄉親多加利用，以紓解節慶時期之龐大人潮，降低群聚感染之風險。
清明節是華人一個重要的傳統節日，許多家庭習慣全家到親人的墓地掃墓，奉上祭品和鮮花等，祭拜祖先，屆時會有許多旅台民眾返鄉祭祖，各鄉鎮地區的公墓區勢必會湧入大批掃墓祭祖的人潮。但現在正值新冠肺炎疫情持續擴散，如何控管這種民俗性的大型集會，內政部日前已函請地方政府輔導轄內公私立殯葬設施，於疫情期間停止辦理千人以上的大型清明法會，如需辦理，應落實各項防護措施，並規劃適當活動空間，保持空氣流通，亦得透過網路直播等方式參與。因應指揮中心頒布的活動指引，目前已將納骨塔法會取消，呼籲民眾分流掃墓祭祖，同時應配戴口罩、避免近距離接觸、保持洗手的習慣；如有發燒等症狀，請暫勿前往掃墓祭祖，減少人群聚集接觸感染風險。
金門在清明節及冬至日都有傳統祭祖習俗，祭祖後並舉行吃頭餐會，依據各宗祠的春、冬兩祭，或是宗祠祭祖等不同活動，輪流作頭，也利用「吃頭」餐會，分居各地的族人相聚一堂，商討宗族的事務，也藉由餐會來聯絡情感，拉近宗親情誼。在新冠肺炎疫情嚴峻之時，囿於一般清明節習俗的壓力，各姓氏慎思防疫優先的前提下，需要改變國人掃墓形式和宗親「吃頭」的習俗，民政處對鄉親作柔性呼籲，提前宣導人員分流的防疫概念，也希望大家能發揮意見領袖的影響力，透過道德勸說的力量，讓全體鄉親都能平安渡過防疫關鍵期。對此，所幸各宗族配合政府防疫工作，大都採祭典儀式與掃墓照常舉行，藉以慎終追遠，宏揚祖德，祈求祖先能庇佑所有裔孫平安，取消吃頭餐敘活動，共同為防疫努力。
縣長楊鎮浯認為祭祖不忘防疫，慎重莊敬表心意，祖先一定希望並保佑子孫平安。清明節是金門人的大節日；祭祖吃頭，緬懷追思先人，是金門慎終追遠、飲水思源不忘本的傳統習俗！今年情況比較特殊，清明節遇到新冠肺炎疫情升溫期，為配合中央防疫政策、減少群聚感染、確保鄉親健康，縣府採取更積極的掃墓防疫管制措施，非常時期簡約祭祖表心意。